结论前置：针对您提出的“门市和二房东没有合同但是办不了营业执照退房费怎么办”的问题，以下是从不同角度给出的分析和建议。
一、法律关系分析
租赁合同关系：
- 尽管您与二房东之间没有签订书面的租赁合同，但根据《民法典》的相关规定，口头合同在符合一定条件下（如双方意思表示真实、内容合法等）同样具有法律效力。因此，您与二房东之间可能存在事实上的租赁合同关系。
- 若二房东无法提供办理营业执照所需的合法手续或证明，导致您无法正常使用门市进行经营活动，这可能构成二房东的违约行为。
营业执照办理：
- 办理营业执照通常需要提供租赁合同、产权证明等文件。若因二房东的原因导致您无法提供这些文件，进而无法办理营业执照，您有权要求二房东承担相应的责任。
二、解决方案建议
与二房东协商：
- 首先，您可以尝试与二房东进行协商，说明因无法办理营业执照而给您带来的损失，并要求二房东退还已支付的房费或提供其他合理的解决方案。
- 在协商过程中，您可以要求二房东提供办理营业执照所需的合法手续或证明，以便您能够正常使用门市。
收集证据并准备诉讼：
- 若协商无果，您可以开始收集相关证据，如支付房费的凭证、与二房东的沟通记录、无法办理营业执照的证明等。
- 准备好证据后，您可以考虑向法院提起诉讼，要求二房东退还房费并赔偿因无法办理营业执照而给您带来的损失。在诉讼过程中，法院将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。
向相关部门投诉：
- 若您认为二房东的行为涉嫌违法或违规，您还可以向当地的房地产管理部门、市场监管部门等相关部门进行投诉。
- 相关部门在接到投诉后，将进行调查并依法处理二房东的违法行为。
三、注意事项
保留证据：
- 在整个过程中，您务必保留好所有与二房东的沟通记录、支付凭证等相关证据，以便在需要时能够证明自己的权益。
及时行动：
- 若您发现无法办理营业执照且二房东拒绝退还房费或提供其他解决方案，建议您及时采取行动，避免因拖延而给自己带来更大的损失。
咨询专业意见：
- 虽然我作为孙侠律师已经给出了上述分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在采取任何行动之前，您还可以考虑咨询其他专业律师的意见，以便更全面地了解自己的权益和可能的法律后果。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况给出更详细的建议。
总结：针对您提出的问题，我建议您首先与二房东进行协商，尝试解决无法办理营业执照和退还房费的问题。若协商无果，您可以考虑收集证据并准备诉讼，或者向相关部门进行投诉。在整个过程中，请务必保留好相关证据并及时行动。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。