不可以以任意理由扣除全勤工资。全勤工资作为员工工资的一部分，其扣除需遵循法律法规及劳动合同的明确约定。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律法规层面

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。全勤工资作为员工因全勤而获得的奖励性工资，同样受到法律保护。除非存在以下情形，否则用人单位不得随意扣除全勤工资：

1. 员工存在过错：如员工违反公司规章制度、迟到早退、旷工等，且公司规章制度中明确规定了此类行为将扣除全勤工资或相应比例的工资。但扣除的比例和方式需合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
2. 双方约定：如果劳动合同或公司规章制度中明确约定了全勤工资的扣除条件和比例，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按照约定扣除全勤工资。但此类约定需经员工签字确认，且不得损害员工的合法权益。
3. 法律法规规定：在某些特殊情况下，如员工因违法犯罪被追究刑事责任等，用人单位可能根据法律法规的规定扣除员工的工资，包括全勤工资。但这种情况较为罕见，且需严格遵循法律法规的规定。

二、实际操作层面

在实际操作中，用人单位扣除全勤工资时需注意以下几点：

1. 规章制度合法性：公司规章制度需经民主程序制定，且内容合法、合理。如果规章制度中关于全勤工资扣除的规定违反了法律法规的强制性规定，那么该规定将无效，用人单位不得据此扣除全勤工资。
2. 通知与告知义务：用人单位在扣除全勤工资前，需通知员工并告知扣除的原因、比例和依据。如果员工对扣除有异议，用人单位需提供充分的证据证明其扣除行为的合法性。
3. 不得恶意扣除：用人单位不得以恶意扣除全勤工资的方式变相降低员工工资或迫使员工离职。如果用人单位存在此类行为，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

三、法律后果

如果用人单位以任意理由扣除全勤工资，可能面临以下法律后果：

1. 补发工资：员工有权要求用人单位补发被扣除的全勤工资。
2. 经济补偿：如果用人单位的行为构成违法解除劳动合同或未按照劳动合同约定支付劳动报酬等情形，员工还有权要求用人单位支付经济补偿。
3. 行政处罚：用人单位还可能面临劳动监察部门的行政处罚，如罚款、责令改正等。

建议：作为员工，如果发现用人单位以任意理由扣除全勤工资，可以先与用人单位协商解决。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。