机关、事业单位工作人员在停职期间，工资的处理方式需根据停职原因及单位性质进行区分，具体如下：

1. 因违纪违法被停职

• 行政机关公务员：根据《行政机关公务员处分条例》，若停职是调查程序的一部分（如涉嫌违纪违法），停职期间一般暂停发放工资，改按基本工资的70%发放生活费（具体比例可能因地区或单位规定略有差异）。若最终认定无过错，需补发差额；若认定有责任，则可能扣发或追缴部分工资。
• 事业单位工作人员：依据《事业单位工作人员处分暂行规定》，停职期间工资处理类似公务员，但具体比例可能由单位或主管部门制定。若停职与处分相关，工资可能按“基本工资+绩效工资”的一定比例发放，最终处分决定会影响工资补发或扣减。

2. 因单位内部管理需要停职（如轮岗、培训）

• 工资全额发放：若停职非因个人过错（如单位安排的临时性工作、培训等），工资、津贴、补贴等应全额发放，不影响福利待遇。
• 特殊情况：若停职期间未实际提供劳动（如长期病假、事假），则按单位考勤制度扣发部分工资（如病假工资按工龄比例发放）。

3. 因涉嫌犯罪被采取强制措施

• 刑事拘留或逮捕期间：根据《关于事业单位工作人员和机关工人被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》，停发工资，改按原基本工资的75%发放生活费。若最终无罪释放，需补发工资；若被判刑，则按判刑后待遇处理。
• 取保候审、监视居住期间：若未被停职，一般正常发放工资；若被停职，则可能按生活费标准发放。

4. 单位规章制度或合同约定

• 部分单位可能在内部规章制度或劳动合同中明确停职期间的工资待遇（如按一定比例发放），需优先遵守单位规定，但不得低于法定最低标准。

关键提醒：

• 地区差异：各省可能出台具体实施细则（如《XX省机关事业单位工作人员停职期间工资待遇办法》），需结合当地政策。
• 证据保留：若对停职或工资处理有异议，建议保留停职通知、工资条等证据，通过单位内部申诉或劳动仲裁维权。
• 及时沟通：停职期间应主动与单位人事部门沟通，明确停职原因、期限及工资待遇，避免信息不对称导致损失。

如有具体案例或地区政策疑问，可进一步说明情况，我会为您详细分析。