针对您提出的“保险公司称停运费属于间接损失不赔”的问题，这确实是一个涉及保险合同条款、保险类型以及法律实践的综合性问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、保险类型与合同条款的影响
交强险：
- 交强险主要赔偿因交通事故造成的人身伤亡和财产直接损失。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及相关条款，停运费作为间接经济损失，通常不在交强险的赔偿范围内。
商业第三者责任险：
- 商业三者险的赔偿范围则需依据具体合同条款来确定。如果合同中明确排除了“停运损失”等间接损失，那么保险公司有权不予赔付。
- 但值得注意的是，部分高端商业险或定制条款可能包含停运损失赔偿，这通常需要投保时特别约定并支付额外保费。因此，在购买商业三者险时，务必仔细阅读合同条款，了解赔偿范围和免责事项。
车辆损失险或其他专项保险：
- 对于营运车辆，如出租车、货车等，可能存在针对停运损失的特殊险种。如果车主购买了此类险种，并且事故责任在保险范围内，那么保险公司可能会按照合同约定进行赔偿。
- 但同样需要注意，此类险种也可能存在免责条款，如驾驶员无从业资格证、车辆未年检等情形可能导致拒赔。
二、法律支持与争议处理
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条，合理停运损失确实可以获得赔偿。但该条款并未明确赔偿责任主体为保险公司，而是指向了侵权人（如肇事方）。
- 在实际判决中，法院可能会根据公平原则要求侵权人赔偿停运损失，而非直接判定保险公司承担。
司法实践差异：
- 司法实践中，对于保险公司是否应赔偿停运损失存在不同观点。部分案例中，如果保险合同未明确排除停运损失，法院可能支持受害人向保险公司索赔。
- 然而，在多数情形下，保险公司会以“间接损失非保险责任”为由进行抗辩，最终由肇事方个人承担赔偿责任。
三、实际操作建议
投保前确认条款：
- 在购买车险时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于赔偿范围和免责事项的部分。如有必要，可向保险公司咨询是否提供停运损失险或相关附加险。
保留证据：
- 发生事故后，及时收集停运期间的收入证明（如银行流水、运营记录等）、维修记录等证据。这些证据将有助于您在后续索赔过程中证明停运损失的具体数额。
协商与诉讼策略：
- 如果保险公司拒赔，您可以先尝试通过协商解决。在协商过程中，可以引用相关法律法规和合同条款来支持自己的主张。
- 如果协商不成，您可以考虑向法院起诉。在起诉前，建议咨询专业律师以了解诉讼风险和策略。同时，注意诉讼时效问题，确保在法定时限内提起诉讼。
综上所述，保险公司是否赔偿停运费取决于多种因素，包括保险类型、合同条款以及司法实践等。在购买保险时，请务必仔细审查合同条款并了解保险赔偿范围和免责条款。如遇到保险公司拒赔的情况，可考虑通过法律途径维护自己的合法权益。