结论前置：不连续旷工三天是否算自动离职，需依据公司规章制度判断，但公司无权因此随意扣押工资。
一、不连续旷工三天是否构成自动离职
公司规章制度是关键：
- 员工是否因不连续旷工三天而被视为自动离职，主要取决于用人单位的规章制度。若规章制度中明确规定了此类情形下的处理方式，如“无故旷工满三天即视为自动离职”，则在此情况下，员工的行为可能构成自动离职。
- 但需注意，规章制度必须合法有效，且已向员工公示或告知，否则可能无法作为处理依据。
法律无统一规定：
- 我国法律对旷工的具体天数并未作出统一规定，而是授权用人单位根据自身情况设定相关标准。因此，在判断不连续旷工三天是否构成自动离职时，应首先参考用人单位的具体规章制度。
二、公司是否有权利扣押工资
无权随意扣押：
- 根据《工资支付暂行规定》及相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。除非存在法定情形（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等），否则用人单位不得克扣劳动者的工资。
- 即使员工因不连续旷工三天被认定为自动离职，对于其已经正常出勤并付出劳动的时间，公司仍有义务按照约定支付相应的工资。
旷工处理需合法合规：
- 如果公司有明确且合法有效的规章制度，规定了旷工等违纪行为的处理方式（如扣除旷工期间的工资等），那么公司可以依此进行处理。但这种扣除应在合理范围内，并且不能涉及劳动者已正常出勤期间的工资。
- 员工的旷工行为如果给公司造成了实际的经济损失，公司可以通过合法途径要求员工承担相应的赔偿责任。但这与正常工资的支付是两个不同的法律关系，不能相互混淆。
三、劳动者如何应对
积极沟通：
- 遇到公司因旷工行为扣押工资的情况，劳动者应首先与公司进行友好沟通，要求公司按照法律规定支付工资。
寻求法律帮助：
- 若沟通无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资；或者申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。仲裁机构会根据具体情况裁定公司支付拖欠的工资，甚至可能要求公司支付经济补偿等。
总结与建议：不连续旷工三天是否算自动离职，需依据公司规章制度判断。但无论何种情况，公司都无权随意扣押劳动者的工资。劳动者在遇到此类问题时，应积极与公司沟通并寻求法律帮助以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。