基于违法强拆后签订的协议，诉讼主张协议无效，能否胜诉，需视具体情况而定，但存在较大胜诉可能性。以下从不同角度进行分析：
一、违法强拆对协议效力的影响
违法强拆行为本身违反了《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国城乡规划法》以及《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规。若强拆行为被确认违法，那么在此背景下签订的补偿协议，其合法性自然会受到质疑。因为，一个基于违法行为而产生的协议，很可能因缺乏合法基础而无效。
二、协议无效的法律依据
《中华人民共和国民法典》相关规定：
- 根据《民法典》第一百五十三条：“违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。”违法强拆行为显然违反了法律的强制性规定，因此，基于该行为签订的协议，有可能被认定为无效。
- 同时，《民法典》第一百五十四条也规定：“行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。”如果签订协议的过程中存在恶意串通，损害第三方利益的情况，该协议同样无效。
协议签订过程中的瑕疵：
- 如果在签订协议时，存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，导致被拆迁人在违背真实意思的情况下签订了协议，那么根据《民法典》的相关规定，该协议也是可以被撤销的，而在某些情况下，撤销与宣告无效在法律效果上具有相似性。
三、诉讼主张协议无效的注意事项
收集证据：
- 要成功主张协议无效，首先需要收集充分的证据来证明强拆行为的违法性，以及该违法行为与协议签订之间的因果关系。这可能包括强拆现场的照片、视频、政府部门的行政决定书、法院的判决文书等。
法律程序：
- 诉讼过程中，需要遵循严格的法律程序，包括起诉、答辩、举证、质证、辩论等环节。确保每一步都符合法律规定，是胜诉的关键。
专业律师的协助：
- 由于涉及复杂的法律问题和证据收集，建议寻求专业律师的协助。律师可以提供专业的法律意见，帮助制定诉讼策略，提高胜诉的可能性。
四、可能面临的挑战
尽管存在较大胜诉可能性，但诉讼过程中也可能面临一些挑战，如证据收集的难度、对方可能提出的抗辩理由等。因此，在决定诉讼前，应充分评估风险，制定合理的诉讼策略。
总结与建议：基于违法强拆后签订的协议，诉讼主张协议无效存在较大胜诉可能性。但具体能否胜诉，还需根据案件的具体情况、证据的充分性以及法律程序的遵循情况等因素综合判断。如果你正面临此类问题，建议直接向我咨询，以便提供更具体的法律建议。