结论：法官在判决中主动适用新的法律关系，并不一定违法，但需要满足一定的条件。

分析：

1. 法官的职权与职责：

   • 法官在审理案件时，有责任根据事实和法律作出公正的判决。这包括对案件涉及的法律关系进行准确识别和适用。
   • 如果法官在审理过程中发现，案件涉及的法律关系与当事人主张的不一致，或者存在更合适的法律关系来适用，法官有权并应当主动进行识别和适用。

2. 法律关系的识别与适用：

   • 法律关系的识别是法官审理案件的重要环节。法官需要根据案件事实，结合相关法律规定，准确判断案件涉及的法律关系。
   • 如果被告代理人没有提出某种法律关系，但法官在审理过程中发现该法律关系对案件处理有重要影响，法官可以主动适用。这并不违反法律规定，因为法官的职责是确保法律的正确适用，而非仅仅局限于当事人提出的观点。

3. 程序公正与实体公正：

   • 法官在适用新的法律关系时，应当确保程序公正。这包括给予当事人充分的陈述和申辩机会，确保当事人对新的法律关系有充分的了解和准备。
   • 如果法官在适用新的法律关系时违反了程序公正原则，如未给予当事人充分的陈述和申辩机会，那么这种适用可能是违法的。

4. 可能的法律后果：

   • 如果法官正确适用新的法律关系，且程序公正，那么这种适用是合法的，不会产生不良的法律后果。
   • 如果法官错误适用新的法律关系，或者违反了程序公正原则，那么当事人可以依法提出上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。

建议：

• 对于当事人而言，如果认为法官在判决中主动适用了不恰当的法律关系，或者违反了程序公正原则，可以依法提出上诉或申请再审。
• 在诉讼过程中，当事人应当积极行使自己的诉讼权利，如陈述、申辩、举证等，以确保案件得到公正处理。
• 如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。