在法院拍卖房屋流拍后由申请人接受过户的情况下，案外人能否提出异议，需分情况讨论：
若案外人提出异议的时间在执行终结前，且执行标的未发生所有权转移：
- 根据《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》的相关精神，执行程序终结通常指的是执行完毕、终结执行、销案、不予执行、驳回申请等情形。而房产拍卖流拍后由申请人接受过户，仅是执行程序中的一个环节，执行尚未终结。
- 在此情况下，如果案外人认为执行行为违反法律规定，或者对执行标的享有足以排除强制执行的权益，那么案外人可以在执行终结前提出执行异议。但需要注意的是，这种异议的提出应当基于合法的权益和充分的证据。
若案外人提出异议的时间在执行标的所有权已经转移后：
- 如果房屋已经因法院的强制执行而发生所有权的转移，即执行标的已经执行终结，那么案外人通常不能再提出执行异议。因为此时执行标的已经不再属于原被执行人，案外人的异议已经失去了指向的对象。
- 具体来说，如果房屋流拍后由申请人接受过户，且法院已经作出了过户裁定并将裁定送达给了申请人，那么至此案涉执行标的已执行终结。在此之后，案外人再提出执行异议，法院可能不会予以支持。
法律建议：
- 对于案外人而言，如果认为执行行为存在问题或者对执行标的享有权益，应当及时关注执行程序的进展，并在执行终结前提出执行异议。
- 提出异议时，案外人需要提供充分的证据来支持自己的主张，否则可能面临异议被驳回的风险。
- 如果案外人对法院的裁定不服，还可以依法提起执行异议之诉来维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果案外人未能在规定的时间内提出执行异议，或者提出的异议被法院驳回，那么案外人可能无法再通过执行异议程序来维护自己的权益。
- 在某些情况下，如果案外人的权益确实受到了侵害，还可以考虑通过其他法律途径来寻求救济，比如提起侵权之诉等。但需要注意的是，这些途径可能更加复杂和耗时。
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