公安机关在办理刑事案件时调取行政单位的证据材料，是否需要行政单位内部审批，取决于具体的法律规定和行政单位的内部管理规定，但通常而言，并不直接要求行政单位进行内部审批，而是需要遵循法定程序和规定。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、法定程序与规定

1. 法律授权：公安机关在办理刑事案件时，有权依法调取与案件有关的证据材料。这种权力来源于法律的明确授权，如《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律法规。因此，从法律层面讲，公安机关调取证据材料是合法的，且通常不需要行政单位的额外审批。

2. 调取证据的程序：公安机关在调取证据材料时，应当遵循法定的程序和规定。这包括出示相关的法律文书（如调取证据通知书）、说明调取证据的理由和依据、以及确保调取过程的合法性和正当性。行政单位在接到公安机关的调取证据通知后，有义务配合并提供相关证据材料。

二、行政单位的内部管理规定

1. 内部审批流程：虽然法律没有直接要求行政单位对公安机关调取证据材料进行内部审批，但行政单位可能根据其内部管理规定，对涉及敏感信息或重要资料的调取进行一定的内部审核或登记。这种审核或登记主要是为了确保行政单位内部资料的安全和管理，而非对公安机关调取证据行为的合法性进行审批。

2. 配合义务：行政单位在接到公安机关的调取证据通知后，应当积极配合并提供相关证据材料。如果行政单位认为调取行为存在违法或不当之处，可以通过法律途径进行救济，如提出异议或申请行政复议等，但这并不改变其配合公安机关调取证据的法定义务。

三、实际操作中的注意事项

1. 沟通与协调：在实际操作中，公安机关与行政单位之间应当保持良好的沟通与协调。公安机关在调取证据前，可以与行政单位进行预沟通，说明调取证据的目的和范围，以便行政单位提前做好准备和配合工作。

2. 保护行政单位权益：公安机关在调取证据过程中，应当尊重行政单位的合法权益，不得侵犯其正常的工作秩序和资料安全。如果调取行为对行政单位造成了损失或影响，公安机关应当依法承担相应的责任。

建议：

• 公安机关在调取行政单位证据材料时，应严格遵守法定程序和规定，确保调取行为的合法性和正当性。
• 行政单位在接到调取证据通知后，应积极配合并提供相关证据材料，同时可以关注其内部资料的安全和管理。
• 如果双方在调取证据过程中发生争议或纠纷，可以通过法律途径进行解决和救济。

如有任何进一步疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。