鉴定程序违法时，法院本身不直接承担责任，但会依法对违法鉴定行为进行处理，并可能因此影响案件的审理结果。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法院对违法鉴定行为的处理
重新鉴定：
- 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第四十条，若鉴定程序严重违法，当事人有权申请重新鉴定。法院在审查确认鉴定程序确实存在违法行为后，应当准许重新鉴定。重新鉴定期间，原鉴定意见不得作为认定案件事实的根据，直至新的鉴定意见作出。
排除违法鉴定意见：
- 法院在审理案件时，若发现鉴定程序违法，导致鉴定意见不具有合法性、真实性或关联性，将依法排除该鉴定意见，不将其作为认定案件事实的依据。
对鉴定人的处罚：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十四条，如果鉴定人故意违反鉴定程序，法院可以根据情节轻重对其予以罚款或拘留。罚款的金额将根据违法行为的严重程度和法院裁量而定，拘留则通常是对较为严重的违法行为采取的强制措施。
二、违法鉴定行为的法律后果
民事责任：
- 鉴定机构或鉴定人因违法鉴定行为给当事人造成损失的，应承担相应的民事赔偿责任。赔偿范围可能包括直接经济损失（如鉴定费用、增加的诉讼费用等）和合理的间接损失（如商业机会丧失等）。
行政责任：
- 司法行政机关可对违法鉴定机构进行警告、罚款、暂停执业、吊销执业证书等行政处罚。对违法鉴定人，也可给予相应的行政处罚，如警告、责令改正、罚款、暂停执业等。
刑事责任：
- 如果鉴定程序的违法行为构成犯罪，如伪证罪等，鉴定人还将被依法追究刑事责任。依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，鉴定人可能面临有期徒刑、拘役等刑罚，具体罪名和刑期由法院根据犯罪事实和法律规定判定。
三、对案件审理的影响
影响案件事实认定：
- 违法鉴定行为可能导致鉴定意见不准确、不真实，从而影响法院对案件事实的认定。若法院采纳了违法的鉴定意见，可能导致案件处理结果不公正。
延长审理周期：
- 因违法鉴定行为需要重新鉴定时，将延长案件的审理周期。重新鉴定需要时间进行，可能导致案件长时间无法审结。
损害司法公信力：
- 违法鉴定行为不仅损害当事人的合法权益，还损害司法公信力。公众对司法鉴定的信任度降低，可能影响司法制度的权威性和有效性。
四、建议与措施
加强监管：
- 司法行政机关应加大对鉴定机构的监管力度，确保其依法依规开展业务。对违法鉴定行为进行严厉打击，维护司法鉴定的公正性和权威性。
提高鉴定人素质：
- 通过培训和教育提升鉴定人的专业素养和职业道德水平。确保鉴定人具备扎实的专业知识和良好的职业道德，减少违法鉴定行为的发生。
完善法律法规：
- 不断完善司法鉴定相关法律法规和行业规范，为司法鉴定提供明确的法律指引。明确违法鉴定行为的法律责任和处罚措施，提高违法成本。
加强信息公开：
- 推动鉴定机构信息公开透明，接受社会监督。建立鉴定机构和鉴定人的信用档案，对违法鉴定行为进行记录和公示。
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