针对您提出的“部门安排员工只打卡不出勤被处理责任在谁”的问题，这实际上涉及到了员工考勤管理、劳动合同履行以及用人单位规章制度执行等多个层面。以下是我对此问题的详细分析：
一、责任归属的基本原则
在劳动关系中，用人单位和员工都负有相应的义务。用人单位有义务提供合理的工作条件、支付劳动报酬，并按照法律法规和劳动合同约定管理员工。员工则有义务遵守用人单位的规章制度，按时出勤，完成工作任务。当出现“只打卡不出勤”的情况时，责任的归属需要依据具体情况来判断。
二、可能的情况及责任分析
用人单位安排员工只打卡不出勤：
- 如果这种情况是用人单位明确安排的，比如为了应对某种检查或临时调整工作安排，但未及时与员工沟通或未在规章制度中明确，那么当员工因此被处理时，责任主要在于用人单位。因为用人单位未能履行好管理职责，导致员工误解或无法遵守规定。
- 用人单位应承担因管理不善导致的后果，包括但不限于与员工沟通解释、调整考勤制度、避免类似情况再次发生等。
员工个人行为导致只打卡不出勤：
- 如果员工未经用人单位同意，擅自只打卡不出勤，那么责任主要在于员工。员工违反了用人单位的规章制度和劳动合同约定，应承担相应的责任。
- 用人单位有权根据规章制度对员工进行处理，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。
考勤系统或管理漏洞导致：
- 有时候，“只打卡不出勤”可能是由于考勤系统故障或管理漏洞导致的。比如，打卡机时间设置错误、考勤软件数据丢失或错误等。
- 在这种情况下，责任可能在于用人单位的技术支持或管理部门。用人单位应及时修复系统漏洞、调整考勤管理方式，并确保员工的合法权益不受损害。
三、建议与措施
加强沟通与培训：
- 用人单位应加强与员工的沟通，明确考勤制度和要求，确保员工了解并遵守。
- 定期对员工进行考勤制度培训，提高员工的合规意识。
完善考勤管理制度：
- 用人单位应制定完善的考勤管理制度，明确打卡、出勤、请假等流程和要求。
- 确保考勤管理制度的合法性和合理性，避免与法律法规相冲突。
及时处理与反馈：
- 当出现“只打卡不出勤”的情况时，用人单位应及时调查原因，并根据实际情况进行处理。
- 处理结果应及时反馈给员工，确保员工的知情权和申诉权。
四、法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位和员工都应遵守法律法规和劳动合同约定，履行各自的义务。当出现争议时，双方应协商解决；协商不成的，可以依法申请劳动仲裁或提起诉讼。
综上所述，部门安排员工只打卡不出勤被处理的责任归属需要依据具体情况来判断。用人单位应加强管理、完善制度、加强沟通与培训，以避免类似情况的发生。同时，员工也应遵守规章制度和劳动合同约定，共同维护良好的劳动关系。