结论是：公司因您少做一天而让您办理离职，这本身不应影响您底薪的发放，但具体还需看劳动合同和公司规章制度的约定以及实际离职情况。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、劳动合同和公司规章制度的角度
劳动合同约定：
- 首先，需要查看您与公司签订的劳动合同中关于工资发放和离职的条款。如果合同中明确规定了无论员工是否做满整月，公司都应按照实际工作天数或约定方式发放底薪，那么公司让您办理离职就不应影响底薪的发放。
- 如果合同中没有明确规定，或者规定与实际情况存在歧义，那么就需要参考公司规章制度或相关法律法规。
公司规章制度：
- 公司可能有自己的规章制度，关于员工离职时工资的发放方式。如果规章制度中明确规定了离职时底薪的发放方式，并且该规章制度不违反法律法规，那么应按照规章制度执行。
- 如果规章制度中没有明确规定，或者规定与法律法规相冲突，那么应优先适用法律法规。
二、法律法规的角度
《中华人民共和国劳动法》：
- 根据《劳动法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，除非有合法依据（如员工严重违反公司规章制度等），否则公司不应因员工少做一天而扣发底薪。
- 如果公司因您少做一天而扣发底薪，且没有合法依据，那么您有权向劳动监察机构投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资。
离职类型与工资发放：
- 如果您是主动离职，且离职原因与公司无关（如个人原因等），那么公司应按照实际工作天数或约定方式发放底薪。
- 如果您是被公司辞退，且辞退原因不符合法律法规规定的可以扣发工资的情形（如员工严重违反公司规章制度、给公司造成重大损失等），那么公司同样应发放底薪。
- 在您的情况下，如果公司仅因您少做一天而让您办理离职，且没有合法依据，那么这应被视为公司单方面解除劳动合同，且不应影响底薪的发放。
三、实际离职情况的角度
- 离职手续办理：在办理离职手续时，您应确保与公司就工资发放等事项达成一致，并要求公司出具书面证明或结算单，以明确工资发放的金额和时间。
- 证据保留：如果公司拒绝发放底薪或存在其他争议，您应保留好相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录、离职证明等），以便在需要时向劳动监察机构投诉或提起劳动仲裁。
建议：
- 首先，与您公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司对于离职时工资发放的具体规定和做法。
- 如果沟通无果，或者您认为公司的做法违反了法律法规或劳动合同约定，那么您可以向当地的劳动监察机构投诉或提起劳动仲裁。
- 在整个过程中，请确保保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。
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