若公司内部发生盗窃但缺乏证据，可按以下步骤处理：
一、内部调查与证据收集
细致检查现场：
- 组织相关人员对可能的盗窃现场、涉及物品存放区域进行细致检查，查看有无异常痕迹或线索，如物品摆放是否整齐、有无翻动痕迹等。
询问相关员工：
- 询问可能知晓情况的员工，了解事发前后的相关状况。但要注意询问方式的合法性，避免侵犯他人权益，如不得采用威胁、逼迫等非法手段。
借助技术手段：
- 查看公司内部监控录像，若有监控覆盖事发区域，可能从中获取关键证据，如盗窃者的面貌、行为等。
- 检查公司的门禁系统、电子打卡记录等，确定在特定时间出入相关区域的人员，以缩小嫌疑人范围。
二、报警处理与专业侦查
向公安机关报案：
- 若经内部调查仍无法获取足够证据，但高度怀疑存在盗窃行为，可向公安机关报案。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，任何单位和个人发现有犯罪事实或者犯罪嫌疑人，有权利也有义务向公安机关报案或者举报。
配合专业侦查：
- 公安机关有专业侦查手段，能通过调查走访、技术侦查等寻找证据。公司应积极配合公安机关的侦查工作，提供必要的协助和信息。
三、法律后果与应对措施
民事责任：
- 若盗窃行为不构成犯罪，但给公司造成了经济损失，公司可要求盗窃者承担民事赔偿责任，如赔偿被盗物品的价值等。
刑事责任：
- 若盗窃行为构成犯罪，如盗窃罪或职务侵占罪，将由司法机关追究盗窃者的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
公司内部处理：
- 在证据充足后，若员工行为构成盗窃，公司可依法解除劳动合同。同时，公司应完善内部管理制度，加强员工教育，防止类似情况再次发生。
四、注意事项与风险提示
避免侵犯权益：
- 在调查过程中，公司应避免侵犯员工的合法权益，如不得非法搜查员工身体或物品、不得非法限制员工人身自由等。
谨慎认定与处罚：
- 在未取得确凿证据前，公司不可随意认定员工偷东西并作出处罚，否则可能面临侵犯员工名誉权等法律风险。
及时咨询专业律师：
- 若公司在处理此类事件时遇到法律难题或不确定如何操作，应及时咨询专业律师，以确保公司的合法权益得到保障。
建议：公司在发现内部盗窃但缺乏证据时，应首先进行内部调查与证据收集，若仍无法获取足够证据，可向公安机关报案并配合专业侦查。同时，公司应完善内部管理制度，加强员工教育，以预防类似事件的发生。若遇到法律难题，可直接向我咨询。