当您遭遇店内钱财被盗且目前没有直接证据时，以下是一些建议来帮助您处理这种情况：

一、立即报警

即使您目前没有直接证据，也应立即向当地公安机关报案。警方有专业的侦查权和手段，可以通过现场勘查、走访调查、调取监控录像等多种方式来收集证据。报案时，请尽可能提供详细的案发时间、地点、损失情况以及任何可疑的线索或异常情况。

二、自行收集线索

在报警的同时，您也可以尝试自行收集一些线索，这可能有助于警方的调查。例如：

• 回忆案发情况：仔细回想案发前后的时间线，包括任何可疑人员、车辆或异常行为。
• 检查现场：如果现场还未被完全破坏，检查是否有遗留的指纹、毛发、作案工具等物证。
• 寻找目击证人：询问周边店铺或居民是否有人目睹了可疑情况或人员。
• 查看监控录像：如果店内有监控设备，尽快查看并保存相关录像资料。

请注意，自行收集证据的过程要合法，不可通过非法手段获取证据，以免证据不被采信或引发其他法律问题。

三、配合警方调查

报警后，警方会展开调查，并可能要求您提供进一步的协助或信息。请积极配合警方的调查工作，包括提供证言、辨认嫌疑人、提交相关证据等。

四、法律程序与结果

• 侦查阶段：警方会积极收集证据，运用多种侦查手段调查案件线索。如果经侦查仍无法获取足够证明犯罪嫌疑人有罪的证据，根据“疑罪从无”原则，不能认定犯罪嫌疑人构成盗窃罪。
• 审查起诉阶段：检察院需依据证据判断是否达到起诉标准。如果证据不足，检察院可能作出不起诉决定。
• 审判阶段：法院对被告人定罪须证据确实、充分。如果证据不满足此要求，法院应作出无罪判决。

五、民事救济途径

如果最终无法通过刑事程序追究犯罪嫌疑人的责任，但您确实遭受了经济损失，并且能证明是因他人不当行为引发的合理怀疑，您可以考虑从民事角度寻求救济。例如，通过起诉要求疑似侵权人承担民事赔偿责任。

总之，虽然目前没有直接证据，但通过及时报警、自行收集线索、配合警方调查以及了解法律程序与结果，您仍然有可能维护自己的合法权益。同时，也建议您加强店铺的安全防范措施，以避免类似事件再次发生。