关于停工留薪期延长是否必须要公司申请的问题，这实际上涉及到工伤员工在停工留薪期满后，如需继续治疗，应如何操作以延长停工留薪期的流程。

首先，根据《工伤保险条例》的相关规定，停工留薪期是工伤员工休息治疗的期限，一般情况下不超过12个月。若伤情严重或情况特殊，确实需要超过这个期限进行治疗的，是可以申请延长停工留薪期的。

关键点在于，延长停工留薪期的申请并非必须由公司单独提出。实际上，根据一些地区的具体规定（如参考信息中提到的山东省的相关规定），员工应在停工留薪期满前的一定时间内（如3日内），向本单位提出书面申请，并提交工伤医疗机构出具的休假证明。这意味着，员工本人是申请延长的主体，但需要得到用人单位的同意，并可能需要提供相关的医疗证明文件。

具体流程可能包括：

1. 员工准备材料：包括但不限于工伤医疗机构出具的休假证明、身份证和社保卡复印件、工伤认定书复印件等。
2. 向单位提出申请：员工应在停工留薪期满前，向所在单位提出书面申请，说明延长停工留薪期的理由和所需时间。
3. 单位审核并同意：用人单位在收到员工的申请后，应审核相关材料，并根据员工的实际情况和医疗机构的建议，决定是否同意延长停工留薪期。
4. 提交至相关部门确认（如需要）：在某些情况下，可能需要将申请提交至设区的市级劳动能力鉴定委员会进行确认。

因此，停工留薪期的延长并非必须由公司单独申请，而是需要员工本人提出申请，并得到用人单位的同意。同时，为了确保申请的顺利进行，员工应提前了解并准备好相关的申请材料，并按照规定的流程进行操作。

最后，值得注意的是，不同地区可能对停工留薪期的延长有具体的细化规定，因此在实际操作中，建议员工和用人单位都详细了解并遵循当地的相关规定。