针对您提出的“合同专用章盖成了公章怎么办”的问题，这确实是一个在实际业务操作中可能会遇到的情形。首先，我们需要明确的是，合同专用章和公章在法律上具有不同的效力和用途，但它们的误用并不必然导致合同无效，关键在于合同的实际履行情况和双方的真实意愿。
一、合同效力分析
公章的法律效力：公章是公司对外进行业务活动、签署法律文件的有效凭证，具有最高的法律效力。在合同上加盖公章，通常意味着公司对合同内容的认可和接受。
合同专用章的用途：合同专用章主要用于公司签订合同时使用，以表明合同是公司正式、合法的业务行为。虽然其法律效力略低于公章，但在合同签订场合，它同样具有证明合同真实性和有效性的作用。
误用印章的影响：当合同专用章被误盖为公章时，从法律角度讲，这并不影响合同的效力。因为无论是公章还是合同专用章，都代表了公司的真实意愿和承诺。关键在于合同的内容是否合法、双方是否真实意思表示一致，以及合同是否得到了实际履行。
二、应对措施
及时沟通确认：发现印章误用后，应立即与合同对方进行沟通，说明情况，并确认双方对合同内容的认可和接受。这有助于避免后续因印章问题产生的纠纷。
补充说明或重新盖章：如果条件允许，可以出具一份书面说明，解释印章误用的原因，并确认合同的有效性。或者，在双方同意的情况下，重新在合同上加盖正确的印章。
保留相关证据：为了应对可能出现的纠纷，应妥善保留与合同签订、履行相关的所有证据，包括但不限于合同文本、沟通记录、付款凭证等。
三、法律风险提示
虽然印章误用通常不会影响合同的效力，但为了避免不必要的法律风险，公司应加强对印章的管理和使用规范。具体来说：
明确印章使用范围：制定印章使用管理制度，明确公章、合同专用章等各类印章的使用范围和审批流程。
加强印章保管：指定专人负责印章的保管和使用，确保印章的安全和可控。
提高员工法律意识：加强对员工的法律培训，提高他们对印章重要性和法律后果的认识。
综上所述，合同专用章盖成公章并不必然导致合同无效。关键在于合同的实际履行情况和双方的真实意愿。为了应对可能出现的纠纷，公司应加强对印章的管理和使用规范，并在发现印章误用后及时与对方沟通确认。