针对您提出的“合同用了公章盖章怎么办”这一问题，我会从合同管理的角度，结合相关法律法规和实际操作经验，为您详细解答。
首先，需要明确的是，公司公章是公司对外活动的有形代表和业务凭证，一旦在合同上加盖了公章，就意味着公司对该合同内容的认可和承担相应责任。因此，如果合同已经使用了公章进行盖章，那么公司就需要对该合同承担相应的法律后果。
一、合同盖章后的法律责任
合同效力：依法加盖公章的合同，具有法律效力，对合同双方均具有约束力。公司作为盖章方，需要按照合同约定履行义务，享受权利。
责任承担：如果合同履行过程中出现问题，如对方违约或合同无法履行等，公司作为盖章方可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。
二、公章管理不当的风险及防范
从您提供的信息中，我们可以看到公章管理不当可能带来的风险。例如，他人擅自使用公章签订合同，公司可能不知情但仍需承担责任。为了避免这种情况，公司需要：
建立严格的公章管理制度：明确公章的使用审批流程，实行统一保管、审批使用、登记留痕。确保公章的使用都在公司的控制和监督之下。
明确印章效力：对内发文明确，除公章、合同专用章外，其他印章一律不得用于对外签订合同。这样可以避免部门章、项目章等被滥用对外签订合同，减少公司承担不必要责任的风险。
及时收回公章：在承包、租赁经营合同期满后，企业法定代表人的变更登记后，单位聘用的人被解聘后，应及时收回业务介绍信、合同专用章和盖有公章的空白合同书等，防止他人利用这些文件进行非法活动。
三、合同盖章后的应对措施
如果合同已经使用了公章进行盖章，且公司发现存在风险或问题，可以采取以下措施：
审查合同内容：仔细审查合同内容，确保合同条款合法、合规，且符合公司的利益。如果发现合同存在问题，可以与对方协商修改或解除合同。
加强合同履行监控：在合同履行过程中，加强监控和管理，确保合同按照约定履行。如果发现对方违约或合同无法履行，及时采取措施保护公司的权益。
寻求法律帮助：如果合同纠纷无法通过协商解决，可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式维护公司的权益。
综上所述，合同用了公章盖章后，公司需要对该合同承担相应的法律责任。为了避免公章管理不当带来的风险，公司需要建立严格的公章管理制度，并加强合同履行过程中的监控和管理。如果发现合同存在问题或风险，及时采取措施保护公司的权益。