当一个行为违反多个行政法规时，行政机关会依据相关法律法规和违法行为的实际情况，进行综合考量并作出合理的处罚决定。以下是具体的处理方式和原则：
一、基本原则
一事不再罚原则：根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。这意味着，对于同一违法行为，行政机关不能重复进行罚款处罚。但这一原则并不限制其他种类处罚的实施，如警告、责令停产停业等。
分别裁量，合并执行：行政机关会依据不同行政法规对该行为进行单独考量，确定每个法规下应给予的处罚种类和幅度。在分别裁量的基础上，将各个违法行为的处罚结果进行综合考量，最终确定一个总的处罚决定。
二、具体处理方式
单个违法行为的处理：
- 对于单个违法行为，行政机关应当依法查明事实，并根据违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素，在法定处罚种类和幅度内作出相应的处罚决定。
多个违法行为的处理：
- 当一个行为同时违反多个行政法规时，行政机关需要分别对每个违法行为进行调查取证，并依法作出处罚决定。
- 在作出处罚决定时，行政机关需要考虑各个违法行为之间的关联性以及处罚的合理性。如果多个违法行为之间存在牵连或吸收关系，可能需要按照特定的规则进行处理，如从一重处罚。但在大多数情况下，多个独立的违法行为应分别处罚。
- 处罚决定作出后，行政机关需要依法将各个处罚决定合并执行。这包括罚款的缴纳、责令停产停业的实施等。在合并执行时，要遵循相关法律规定的上限要求，避免处罚过重。
特殊情形的处理：
- 如果一个违法行为同时违反了多个法律规范，且这些法律规范之间存在竞合关系，那么行政机关需要根据具体情况选择适用哪个法律规范进行处罚。在选择适用法律规范时，行政机关通常会考虑违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素。
- 对于一些特殊的违法行为，如连续违法行为或继续违法行为，行政机关可能会根据具体情况采取不同的处理方式。例如，对于连续违法行为，可能会将其视为一个整体进行处罚；而对于继续违法行为，则可能会在违法行为持续期间内持续进行处罚。
三、实际案例说明
假设某企业同时违反了环保法规和安全生产法规，环保部门可能会对该企业处以罚款，并要求其限期整改；而安全生产监管部门则可能会对该企业进行警告，并处以停产整顿的处罚。在这种情况下，两个部门的处罚并不冲突，而是各自根据职责和法规进行独立处理。最终，该企业可能需要同时承担环保部门的罚款和整改要求，以及安全生产监管部门的警告和停产整顿处罚。
四、注意事项
- 保障当事人权利：在处理多个行政处罚案件时，行政机关需要充分保障当事人的陈述权、申辩权等合法权益。当事人有权对处罚决定提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼。
- 遵循法定程序：行政机关在处理多个行政处罚案件时，必须严格遵循法定的程序和规定。这包括立案、调查取证、告知当事人权利、听取当事人陈述和申辩、作出处罚决定等环节。
综上所述，当一个行为违反多个行政法规时，行政机关会综合考虑各方面因素，依法依规作出合理的处罚决定。如果您或您的企业面临此类情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。