针对您提出的“九十年代国企注销，现在是否还可以仲裁当年存在劳动关系”的问题，结论如下：

1. 从仲裁时效的角度分析：

   • 根据现行《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。然而，这一规定是针对现行法律环境下的劳动争议。对于九十年代的情况，由于当时法律环境与现在存在显著差异，且可能涉及历史遗留问题，不能简单地直接适用现行时效规定。
   • 关键在于，如果劳动者在九十年代国企注销时，并未意识到自己的劳动关系权益受到侵害，或者由于历史原因（如档案丢失、单位解散等）导致无法及时主张权利，那么现在提出仲裁申请，可能不会被简单地以超过时效为由驳回。但具体是否受理，还需根据仲裁机构的判断和当地司法实践来确定。

2. 从证据收集的角度分析：

   • 仲裁或诉讼的关键在于证据。对于九十年代的情况，由于时间久远，相关证据（如劳动合同、工资单、工作证等）可能已经丢失或难以获取。这将对证明当年存在劳动关系构成挑战。
   • 如果劳动者能够提供一些间接证据（如同事证言、单位旧档案、社保缴纳记录等），这些证据可能有助于证明当年存在劳动关系。但证据的充分性和证明力将直接影响仲裁结果。

3. 从法律实践的角度分析：

   • 在实际法律实践中，对于历史遗留的劳动关系争议，仲裁机构和法院通常会采取更加谨慎和灵活的态度。他们可能会考虑历史背景、政策变化、单位现状等多种因素，来综合判断是否受理和如何裁决。
   • 如果劳动者能够提出合理的诉求，并提供一定的证据支持，仲裁机构或法院可能会根据具体情况，给予一定的法律救济。但这也取决于当地司法实践和仲裁机构的具体判断。

法律建议：

• 如果您认为自己在九十年代与某国企存在劳动关系，且现在希望确认这一关系或主张相关权益，建议您首先尝试收集相关证据。这包括但不限于寻找旧同事、查询单位旧档案、联系当地社保部门查询社保缴纳记录等。
• 在收集到一定证据后，您可以向当地劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。在申请过程中，您需要详细陈述事实、提供证据，并说明您的诉求。
• 同时，由于历史遗留问题的复杂性，建议您在申请仲裁前咨询专业律师（即向我咨询），以获取更具体的法律建议和指导。

可能面临的法律后果：

• 如果仲裁机构受理了您的申请，并最终裁决确认了您与国企之间的劳动关系，那么您可能有权主张相关的劳动权益（如工资、社保、经济补偿等）。
• 如果仲裁机构以超过时效或证据不足为由驳回了您的申请，那么您可能需要考虑通过其他途径（如诉讼）来主张权益，或者接受无法确认劳动关系的事实。