员工因自身疾病晕倒在工作岗位上，公司是否有责任负责医药费需根据具体情况判断，以下是详细分析：
一、认定为工伤的情况
根据《工伤保险条例》第十五条的规定，职工在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。在此情况下：
若公司为员工缴纳了工伤保险：
- 符合规定的医疗费用将从工伤保险基金中支付。
- 员工还可享受丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金等其他工伤保险待遇。
若公司未为员工缴纳工伤保险：
- 则上述费用需由公司按照工伤保险待遇项目和标准全额支付。
二、未认定为工伤的情况
若员工突发疾病不符合工伤条件，公司通常没有法定义务承担医药费，但存在以下特殊情况需考虑：
一般疾病：
- 员工因自身原因（非工作相关）突发疾病，公司不承担医药费。
- 但员工享有医疗期，期间公司应按规定支付病假工资或疾病救济费，不得低于当地最低工资标准的80%。
公司存在过错：
- 如果员工突发疾病是由于公司过错导致，如工作环境存在有毒有害物质、长期安排超时加班等，公司需根据其过错程度承担相应的赔偿责任，包括医药费。
- 例如，公司未提供必要的劳动防护用品导致员工生病，公司应承担相应的医疗费用及赔偿责任。
三、公司的人道主义关怀
尽管在某些情况下公司没有法定义务承担医药费，但出于人道主义关怀，公司可能会给予员工一定的帮助或慰问金。这并非法律强制要求，而是公司自愿行为，体现了企业对员工的关心和社会责任。
法律建议
- 及时就医并保留证据：员工在突发疾病后，应及时就医并保留好相关医疗费用票据和诊断证明等证据，以便后续维权。
- 与公司协商：员工可以与公司就医药费承担问题进行协商，看是否能够达成一致意见。
- 申请工伤认定：如果员工认为自己的疾病与工作有关，可以向当地社会保险行政部门申请工伤认定，以便享受相应的工伤保险待遇。
- 寻求法律援助：如果员工在维权过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
总结：员工因自身疾病晕倒在工作岗位上，公司是否承担医药费需综合考虑多种因素，包括是否为工伤、公司是否存在过错以及公司的人道主义关怀等。在处理此类问题时，应严格遵循相关法律法规，确保双方权益得到妥善保护。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。