公司以员工离职为由扣取因工作需要而考取证书的费用，通常是不合法的，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：

一、通常情况下的不合法性

根据相关法律法规，员工为了公司工作而进行的考证行为，其费用应视为公司为提升员工业务能力而进行的投资。员工离职时，公司不能以任何理由扣除这部分费用。这是因为，考证行为本身是为了满足公司的工作需求，提升员工的专业技能，从而更好地为公司服务。因此，考证费用应由公司承担，而非员工个人。

二、例外情况

然而，也存在一些例外情况。如果在员工与公司签订的劳动合同或其他相关协议中明确约定了考取证书的费用由员工承担，且员工离职时未履行完协议约定的服务期限，那么公司在一定条件下可以扣除相应比例的费用。但这种扣除也应符合法律法规的规定，且扣除的金额应合理。具体来说：

1. 合同或协议约定：员工与公司之间必须有明确的合同或协议约定，规定考取证书的费用由员工承担，并且约定了服务期限。
2. 未履行完服务期限：员工离职时，如果未履行完合同或协议约定的服务期限，公司可以按照约定扣除相应比例的费用。
3. 扣除金额合理：公司扣除的费用金额必须合理，不能过高或过低，应与员工未履行的服务期限成比例。

三、法律建议

1. 审查合同或协议：员工在离职前，应仔细审查与公司签订的劳动合同或其他相关协议，了解其中关于考证费用承担和服务期限的约定。
2. 与公司协商：如果公司要求扣除考证费用，员工可以与公司进行协商，了解扣除费用的具体原因和金额，并尝试达成和解。
3. 寻求法律帮助：如果员工认为公司的扣除行为不合法或不合理，可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

举例说明：假设员工小张与公司签订了劳动合同，其中约定小张需要考取某项专业证书，费用由小张承担，但服务期限为3年。如果小张在服务期限内离职，公司可以按照约定扣除相应比例的费用。但如果合同或协议中没有此类约定，或者小张已经履行完了服务期限，那么公司就不能扣除考证费用。

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