针对您提出的“将耕地租给他人建农机合作社，租赁合同是否有效，以及无效的后果是什么”这一问题，我将结合相关法律法规，为您进行详细解答。
一、租赁合同是否有效
租赁耕地用于建农机合作社的合同是无效的。原因如下：
违反《中华人民共和国土地管理法》：
- 根据该法第三十七条，禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。建农机合作社通常涉及非农业建设，如建造厂房、仓库等，这直接违反了土地管理法的规定。
- 第七十五条进一步规定，对于违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的行为，将限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，并可能面临罚款等处罚。
违反《中华人民共和国民法典》：
- 民法典第一百五十三条指出，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，租赁耕地用于非农业建设（如建农机合作社）的行为，由于违反了土地管理法的强制性规定，其签订的租赁合同自然无效。
二、合同无效的后果
无法获得法律保护：
- 无效的合同自始没有法律约束力，双方基于该合同所享有的权利和承担的义务均不受法律保护。这意味着，如果因履行合同发生纠纷，当事人无法通过法律途径维护自己的权益。
面临行政处罚：
- 根据土地管理法的规定，对于非法占用耕地进行非农业建设的行为，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令限期改正或治理，并可以处以罚款；构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
经济损失风险：
- 由于合同无效，承租人可能面临已投入资金无法收回的风险，如建筑材料费用、施工费用、设备购置费用等。
- 出租人也可能因提供违法用地而承担相应的法律责任和经济损失，如被要求恢复土地原状、赔偿因非法出租土地给承租人造成的损失等。
三、建议与总结
在签订农村土地租赁合同时，双方应谨慎审查各自的主体资格、合同条款的合法性以及程序的规范性。特别是要确保土地用途符合法律规定，仅限于农业种植、畜牧养殖、林业等农业生产活动，不得改变土地的农业用途用于非农业建设。
建议：在签订此类合同前，务必咨询专业律师进行法律把关，以降低法律风险，保障双方的合法权益。同时，双方应明确合同无效的后果，并提前做好风险防范和应对措施。
综上所述，将耕地租给他人建农机合作社的租赁合同是无效的，且可能面临无法获得法律保护、行政处罚以及经济损失等后果。因此，在签订此类合同时，务必谨慎行事，确保合同的合法性和有效性。