结论前置：用人单位因员工迟到一次就扣工资的做法，可能存在违法情形，具体需结合劳动合同、规章制度及地方性法规综合判断。以下从法律角度分情况说明：

1. 若劳动合同或规章制度未约定迟到扣款，用人单位无权扣减

根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如工资扣减）需经民主程序（如职工代表大会讨论）并公示告知劳动者。若公司未在劳动合同中明确约定迟到扣款条款，或规章制度未经民主程序、未公示，则扣款行为缺乏法律依据，劳动者可要求返还。

2. 若劳动合同或规章制度约定了迟到扣款，需符合“合理性”原则

即使公司有相关约定，扣款金额也需符合以下条件：

• 比例合理：扣款金额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准（依据《工资支付暂行规定》第十六条）。例如，若月工资5000元，迟到一次扣款超过1000元（20%）则违法。
  
• 次数限制：部分地方性法规（如《江苏省工资支付条例》）规定，因劳动者过错造成损失的，每月扣款不得超过当月工资的20%，且累计扣款不得超过当月工资。若公司因一次迟到扣款过高，可能被认定为违法。
  
• 与损失匹配：扣款需与迟到行为造成的实际损失相当。若迟到未导致公司损失（如未影响工作进度），扣款可能被认定为“克扣工资”。

3. 地方性法规可能提供更严格的保护

部分地区对工资扣减有更细致的规定。例如：

• 北京：根据《北京市工资支付规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同约定要求赔偿，但每月扣款不得超过当月工资的20%。
  
• 上海：类似规定，且强调扣款需“与过错程度相适应”。
  若所在地区有此类规定，公司扣款需同时满足国家和地方标准。

建议行动步骤

1. 核查依据：要求公司出示劳动合同、规章制度中关于迟到扣款的条款，确认是否经民主程序制定并公示。
   
2. 计算比例：核对扣款金额是否超过月工资20%，或扣除后是否低于最低工资标准。
   
3. 协商或投诉：若公司行为违法，可先与公司协商返还；协商不成，可向当地劳动监察大队投诉（拨打12333），或申请劳动仲裁（需在1年内提出）。
   

温馨提示：劳动法律问题需结合具体证据和地方规定判断，若涉及复杂情况（如多次扣款、解除合同等），可直接向我咨询，我会进一步分析。