若借款单丢失且对方不承认借款事实，您可以通过收集其他证据来证明债权债务关系的存在，并考虑通过法律途径维护自身权益。以下是一些具体的建议和步骤：
一、收集其他证据
转账记录：
- 无论是银行转账、微信转账、支付宝转账还是其他第三方支付平台的转账记录，都能直观体现资金的流动情况，是证明借款事实的重要证据。
聊天记录与通话录音：
- 保存与对方关于借款的聊天记录，特别是涉及借款金额、时间、用途等关键信息的对话。
- 在与对方沟通时，可以尝试录音，记录对方承认借款的表述。但需注意，录音应在合法、自愿的情况下进行，不得侵犯他人隐私或合法权益。
证人证言：
- 如果有第三方在场见证借款过程，证人的证言也具有一定证明力。可以尝试联系证人，请求其出具书面证言或在法庭上作证。
其他辅助证据：
- 如借款时的照片、视频等，虽然这些证据的证明力可能相对较弱，但在与其他证据形成证据链时，也能起到一定的辅助作用。
二、尝试与对方协商
- 在收集到一定证据后，可以尝试与对方重新进行沟通，引导对方再次承认借款事实，并进行录音或记录沟通内容。这有助于在后续的法律程序中证明借款事实的存在。
三、考虑法律途径
提起诉讼：
- 如果协商无果，您可以考虑向法院提起诉讼，要求对方偿还借款。在诉讼过程中，您需要向法院详细阐述借款的经过，并提供收集到的所有证据。
申请法院调查取证：
- 如果由于客观条件限制，您无法亲自搜集相关证据，可以向法院提出申请，请求其协助进行调查取证。法院将依据相关法规，对必要的证据进行合法的调查与收集。
法院审查与判决：
- 法院会对所有证据进行全面且客观的审查与核实，包括但不限于由当事人提供的证据以及法院自身所收集到的证据。如果证据确实可靠，法院将会依据证据的合法性、关联性以及充足程度做出公正的判决。
四、注意事项
- 证据收集的合法性：任何形式的证据收集都必须遵循合法和合规原则，严禁采用任何手段侵犯他人的合法权益。
- 及时行动：建议您尽早采取行动，收集证据并考虑法律途径，以免因时间拖延而导致证据灭失或对方转移财产等情况发生。
示例说明：
假设您与对方曾通过微信聊天讨论借款事宜，并约定了借款金额和还款时间。在借款单丢失后，您可以保存这些聊天记录作为证据。同时，如果您有银行转账记录显示向对方转账了相应金额，那么这些转账记录也能与聊天记录形成证据链，共同证明借款事实的存在。
法律背景：
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，书证应当提交原件，但提交原件确有困难的，可以提交复制品、照片、副本、节录本等。在法庭上，除了书证外，还可以借助证人的陈述证词、视听资料、电子数据等其他合法有效的证据链来进一步证实债权债务关系的确立。
后续建议：
- 继续收集并保存所有与借款相关的证据。
- 考虑与对方进行协商，看是否能达成还款协议。
- 如果协商无果，及时向法院提起诉讼，维护自身权益。
如果您在处理此类问题时遇到任何困难或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。