结论前置：公司董事长的儿子继承公司后，需根据具体情况完成继承程序、处理股权与控制权问题，并妥善应对公司治理与法律合规事项。以下分情况详细说明：

1. 继承程序与股权过户

• 法定继承：若董事长未立遗嘱，其遗产（包括公司股权）按《民法典》继承编分配。第一顺序继承人为配偶、子女、父母，儿子需与其他继承人协商或通过诉讼确定继承份额，再办理股权变更登记（需提交继承公证书、死亡证明等材料至市场监管部门）。
• 遗嘱继承：若董事长立有合法遗嘱指定儿子为唯一继承人，儿子可直接凭遗嘱及公证材料办理股权过户，流程相对简便。
• 关键点：股权继承可能涉及税费（如印花税、个人所得税，具体视地区政策），需提前规划税务成本。

2. 公司控制权与治理结构调整

• 绝对控股：若儿子继承后持股超50%，可单独控制股东会决策，但需注意：
  • 修改公司章程需代表三分之二以上表决权的股东通过（若原章程有特殊约定）；
  • 董事、监事任免需按章程程序进行，避免程序瑕疵引发纠纷。
• 相对控股或参股：若继承后持股比例较低，需与其他股东协商合作或通过增资扩股巩固控制权，必要时可签订《股东协议》明确权利义务。
• 家族企业特殊情形：若公司存在“一股独大”或家族协议（如“家族宪章”），儿子需遵守既有规则，否则可能面临其他家族成员反对。

3. 公司债务与法律责任承接

• 有限责任原则：根据《公司法》，公司债务以全部财产为限承担责任，股东（包括继承股权的新股东）原则上无需以个人财产偿还公司债务。
• 例外情形：若儿子作为继承人存在以下行为，可能承担连带责任：
  • 滥用股东权利（如抽逃出资、关联交易损害公司利益）；
  • 继承时明知公司存在未清偿债务且未履行通知债权人义务；
  • 继承后未依法清算即注销公司。

4. 实际经营中的注意事项

• 资质与许可：若公司从事需特殊资质的行业（如金融、医疗），儿子需确认自身是否符合法定条件（如年龄、专业资格），否则可能面临行政处罚。
• 劳动用工：继承后需妥善处理与员工的劳动关系，避免因管理层变更引发劳动纠纷。
• 合同履行：需审查公司正在履行的重大合同（如借款合同、合作协议），确认是否需变更签约主体或补充协议。

5. 争议预防与解决建议

• 提前规划：建议董事长在世时通过“家族信托”“股权代持”等方式隔离风险，或订立详细遗嘱明确股权分配及公司治理安排。
• 争议解决机制：若继承过程中发生纠纷（如其他继承人质疑遗嘱效力），可优先通过调解协商解决；协商不成时，及时向法院提起继承纠纷之诉或股东资格确认之诉。

总结：继承公司后，儿子需从法律程序、公司治理、债务承接三方面系统规划，建议结合公司实际情况制定继承方案，必要时可委托律师协助处理股权变更、章程修订等事务。如有具体问题，可直接向我咨询。