在公司发现员工患有重大疾病时，处理方式需要依据相关法律法规和公司政策来谨慎进行。以下是一些建议的处理步骤：
一、了解法律法规
首先，需要明确的是，员工对于自己患有的重大疾病有告知的义务，特别是在入职时。如果员工隐瞒了重大疾病，根据《劳动合同法》的相关规定，这可能构成欺诈，用人单位在特定情况下有权解除劳动合同。但这一处理必须基于合法、公正的原则，并且需要确保员工的合法权益不受侵害。
二、与员工沟通
- 私下沟通：一旦发现员工可能患有重大疾病，应首先与员工进行私下、诚恳的沟通，了解其病情、治疗情况以及工作意愿。
- 提供支持：表达公司对员工的关心和支持，询问是否需要提供任何帮助，如调整工作时间、提供医疗假期等。
三、依据政策处理
- 医疗期规定：根据劳动部《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，对于患病的员工，应给予一定的医疗期。医疗期的长短根据员工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定。
- 劳动能力鉴定：医疗期满后，如果员工病情仍未好转，应进行劳动能力鉴定。根据鉴定结果，决定员工是否能够继续从事原工作或需要调整工作岗位。
- 合同处理：
- 如果员工在入职时隐瞒了重大疾病，且该疾病影响了其正常工作，公司可以根据《劳动合同法》的相关规定，与员工协商解除劳动合同。
- 如果员工在合同期间突发重大疾病，公司应依据医疗期规定和劳动能力鉴定结果来处理合同问题，不得随意解除劳动合同。
四、关注员工福利与权益
- 社保与保险：确保员工享受应有的社保待遇，如医疗保险、工伤保险等。同时，可以探讨是否为员工提供额外的商业保险以减轻其经济负担。
- 隐私保护：在处理员工重大疾病问题时，应严格保护员工的隐私，避免信息泄露给无关人员。
五、预防与应对措施
- 入职体检：加强入职体检环节，确保能够及时发现员工可能存在的健康问题。
- 健康管理：建立员工健康管理制度，定期组织健康检查，提供健康咨询和指导。
- 应急预案：制定针对员工突发重大疾病的应急预案，明确处理流程和责任分工。
总之，在公司发现员工患有重大疾病时，应秉持人文关怀和法律合规的原则进行处理，确保员工的合法权益得到保障，同时维护公司的正常运营秩序。