男子婚后13天起诉要求退彩礼，在一定条件下是合理的。具体分析如下：

一. 法律依据与情形分析

1. 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第五条，当事人请求返还按照习俗给付的彩礼，在特定情形下法院应予支持。这些情形包括未办理结婚登记、已登记但未共同生活，以及婚前给付导致给付人生活困难（需以离婚为前提）。
2. 具体情形：在本案例中，男子与女子已办理结婚登记并短暂共同生活（婚后13天），但男子声称因给付彩礼导致家庭经济困难，且女方患有先天性疾病（双子宫单肾），这可能影响婚姻的长期稳定性。虽然该疾病不属于法律明确界定的“重大疾病”范畴，但隐瞒疾病和短暂的共同生活时间，以及彩礼给付对男方家庭经济造成的影响，是法院在考虑是否返还彩礼时会权衡的因素。

二. 合理性分析

1. 彩礼给付导致生活困难：男子声称结婚及治疗费用大约花费了50万元，其中部分资金是父母借来的，这表明彩礼的给付确实对男方家庭经济造成了较大压力。
2. 共同生活时间短：双方仅共同生活13天，远未达到长期共同生活的目的，这也是法院在考虑返还彩礼时会考虑的一个重要因素。
3. 隐瞒疾病：虽然女方坚称不知道自己患有先天性疾病，但男方认为女方可能隐瞒了病情。如果男方能够收集到相关证据，如聊天记录、就医记录等，证明女方确实隐瞒了疾病，这将进一步支持其要求返还彩礼的合理性。

三. 结论与建议

• 结论：综上所述，男子在婚后13天起诉要求退彩礼，在考虑到彩礼给付导致生活困难、共同生活时间短以及女方可能隐瞒疾病等因素的情况下，是具有一定合理性的。
• 建议：男方应尽可能收集相关证据，如转账记录、礼金清单、聊天记录、就医记录等，以证明彩礼的给付、婚姻关系的短暂以及女方可能存在的隐瞒行为。同时，男方可考虑与女方及其家人协商，寻求部分返还彩礼的解决方案。若协商不成，可向法院提起诉讼，并请求法院根据实际情况判决女方返还部分彩礼。

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