主合同约定仲裁而担保合同约定起诉的情况下，一般不能直接向法院起诉，但存在例外。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：仲裁协议排除法院管辖
根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这意味着，如果主合同和担保合同中明确约定了仲裁条款，且该条款有效，那么当事人应当通过仲裁方式解决纠纷，而不能直接向法院起诉。
二、例外情况：仲裁协议无效或失效
尽管存在仲裁协议，但在某些特殊情况下，当事人仍然可以向法院起诉。这些情况主要包括：
仲裁协议无效：如果仲裁协议约定的仲裁机构不存在，或者仲裁协议的内容不合法（如既裁又诉等），则仲裁协议可能被认定为无效。此时，当事人可以向法院起诉。
当事人放弃仲裁协议：如果一方在起诉时未声明有仲裁协议，而另一方在首次开庭前也未对法院受理该案提出异议，那么视为双方放弃了仲裁协议，法院可以继续审理案件。
三、具体到担保合同的特殊情况
在担保合同中约定起诉条款，而主合同中约定仲裁条款的情况下，如果担保合同是独立于主合同的，且担保合同中的起诉条款明确、有效，那么理论上当事人可以根据担保合同的约定向法院起诉。然而，实践中法院可能会考虑主合同和担保合同的关联性，以及仲裁协议的整体效力。如果法院认为担保合同中的起诉条款与主合同中的仲裁条款存在冲突，或者认为担保合同是主合同的从合同，那么法院可能会以仲裁协议有效为由驳回起诉。
四、建议与风险提示
审查合同条款：在签订合同时，务必仔细审查合同中的争议解决条款，确保主合同和担保合同中的争议解决方式一致，避免出现冲突。
咨询专业律师：如果合同中存在争议解决方式的冲突，或者对仲裁协议的效力有疑问，建议及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见。
注意诉讼时效：如果决定向法院起诉，务必注意诉讼时效的问题，确保在法定的诉讼时效期间内提起诉讼。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律意见。