针对您提出的问题，即执行笔录中原被告签了协议但笔录与法院判决有冲突，且一方不履行时如何执行，以下是我的详细解答：

1. 协议与判决冲突的处理原则：

   • 当执行笔录中的协议与法院判决存在冲突时，首先需明确的是，法院判决具有更高的法律效力。协议若未经法院确认或未被判决所采纳，其效力可能受到限制。
   • 若协议内容确实与判决相悖，且一方拒绝履行判决而坚持按协议执行，此时应优先考虑执行法院判决。因为判决是法院根据事实和法律作出的最终裁决，具有强制执行力。

2. 一方不履行判决时的执行措施：

   • 申请强制执行：若一方不履行法院判决，另一方可以向法院申请强制执行。法院将依法采取查封、扣押、冻结、拍卖等措施，强制被执行人履行义务。
   • 执行异议处理：在执行过程中，若被执行人提出执行异议，认为执行笔录中的协议应优先执行，法院将进行审查。若异议不成立，法院将继续执行判决；若异议成立，法院可能根据具体情况调整执行方案。
   • 追究法律责任：对于拒不履行法院判决的被执行人，法院可以依法对其采取罚款、拘留等强制措施，甚至追究其刑事责任（如拒不执行判决、裁定罪）。

3. 协议在执行中的效力与限制：

   • 协议效力：若协议内容合法且不违反公序良俗，且双方自愿签订，该协议在民事法律关系中通常具有约束力。但在执行阶段，若协议与判决冲突，其效力可能受到限制。
   • 协议限制：协议不得违反法律的强制性规定，也不得损害国家、集体或第三人的利益。若协议存在上述情形，法院在执行时可能不予认可。

4. 实际操作建议：

   • 及时沟通：在发现协议与判决存在冲突时，双方应及时沟通，尝试通过协商达成一致意见，避免执行过程中的不必要的纠纷。
   • 申请法院审查：若协商无果，一方可以向法院申请审查协议与判决的冲突问题，由法院作出最终裁决。
   • 配合执行：在执行过程中，双方应积极配合法院的工作，提供必要的证据和资料，确保执行工作的顺利进行。

总结来说，当执行笔录中的协议与法院判决存在冲突且一方不履行时，应优先考虑执行法院判决。一方可以向法院申请强制执行，并配合法院的工作。若被执行人提出执行异议，法院将进行审查并作出相应处理。在实际操作中，双方应及时沟通并尝试通过协商解决问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。