请假单位扣除底薪是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：

一、用工形式的影响

1. 非全日制用工：

   • 非全日制用工通常以小时计酬，不存在底薪的概念。因此，在非全日制用工形式下，劳动者请事假期间未提供劳动，用人单位不支付该期间报酬是合法的，但这并不涉及底薪扣除的问题。

2. 全日制用工：

   • 在全日制用工形式下，工资应按月以货币形式支付给劳动者，且不得低于当地最低工资标准。若劳动者请事假，用人单位扣除对应工资时，需确保扣除后的工资不低于最低工资标准。

二、劳动合同与公司规章制度的作用

1. 劳动合同有明确规定：

   • 如果劳动合同中明确规定了请事假期间的工资处理方式，如按日扣除工资等，那么应按照合同约定执行。但合同中的规定不能违反法律法规，即扣除后的工资不得低于最低工资标准。
   • 示例：假设某员工月工资为6000元，当月工作日为22天，日工资约为272.73元。若该员工请事假1天，且劳动合同规定按日扣除工资，则扣除272.73元后，剩余工资应不低于当地最低工资标准。

2. 劳动合同无明确规定或不明确：

   • 此时应参考公司规章制度。但规章制度需合理且已告知劳动者，否则不能作为扣款依据。
   • 即便按照规章制度扣款，扣除后的工资仍需满足最低工资标准要求。若规章制度中的扣款规定导致工资低于最低工资标准，则该规定不合法。

三、扣款的合法性判断

• 合法扣款：

  • 请事假期间，用人单位按合理方式扣除对应工资，且扣除后工资不低于最低工资标准，则此扣款合法。

• 非法扣款：

  • 因请事假导致工资低于最低工资标准，无论劳动合同还是公司规章制度，都不能作为降低工资至最低工资标准以下的依据。此时，用人单位的扣款行为不合法。

四、劳动者的权益保护

• 如认为用人单位扣款不合法，劳动者可与用人单位协商解决。
• 协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

建议：

• 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和请假的规定。
• 若公司规章制度涉及扣款，劳动者应确保自己已了解并同意这些规定。
• 如遇扣款不合法的情况，劳动者应及时采取措施维护自己的权益。

有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。