农村建设用地是否可以翻盖厂房，需视具体情况而定，并非绝对合法或非法，关键在于是否符合相关法律法规和审批程序。以下从不同角度进行详细分析：

一、合法翻盖厂房的条件

1. 依法取得审批手续：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，农村建设用地分为宅基地、公益性公共设施用地和经营性用地。翻盖厂房一般使用的是经营性用地，必须确保该用地已依法取得相关审批手续。
   • 若涉及农用地转为建设用地的，还需办理农用地转用审批手续，这是翻盖厂房的前提条件。

2. 符合土地利用总体规划和城乡规划：

   • 土地利用总体规划明确了土地的用途和布局，城乡规划则对建设项目的选址、布局等进行规范。翻盖厂房必须在规划允许的范围内进行，否则可能面临拆除等处罚。

3. 获得相关部门的许可：

   • 建设厂房通常要经过自然资源、住建等部门的审批，办理建设用地规划许可证、建设工程规划许可证、施工许可证等证件。这些证件是翻盖厂房的合法依据。

二、非法翻盖厂房的后果

1. 行政处罚：

   • 未经批准擅自在农村建设用地上翻盖厂房，属于违法行为。根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，违法者将面临限期拆除新建建筑物、恢复土地原状等法律责任，还可能受到罚款等其他行政处罚。

2. 刑事责任：

   • 在某些严重情况下，如非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的，还可能构成非法占用耕地罪，依法追究刑事责任。

三、特殊情况与合法途径

1. 设施农业用地：

   • 若所建厂房属于农业生产配套的设施农业用地范畴（如农产品分拣、初加工场所等），在符合相关规定和要求的情况下可以建设。但设施农业用地也有严格的面积、布局等限制，并需要按照规定进行备案等程序。

2. 集体经济组织兴办企业：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》第六十条，农村集体经济组织可以使用乡（镇）土地利用总体规划确定的建设用地兴办企业。但需持有关批准文件向县级以上地方人民政府自然资源主管部门提出申请，并按规定权限进行批准。

四、建议与注意事项

1. 了解相关法律法规：

   • 在考虑翻盖厂房前，应充分了解相关法律法规和政策要求，确保合法合规地进行建设和经营。

2. 咨询当地部门：

   • 由于不同地区的具体规定可能有所不同，建议咨询当地国土资源、住建等部门，了解具体的审批程序和要求。

3. 谨慎行事：

   • 未经批准擅自翻盖厂房存在较大的法律风险，建议谨慎行事，避免不必要的法律纠纷和经济损失。

总结来看，农村建设用地是否可以翻盖厂房并非绝对合法或非法，关键在于是否符合相关法律法规和审批程序。若有进一步疑问或需要具体法律帮助，可以直接向我咨询。