针对您提出的“子公司变分公司员工怎么处理”的问题，这涉及到公司组织结构变更时员工安置的法律与实务操作，以下是我为您提供的详细解答：

一、法律原则与基础

首先，需要明确的是，子公司与分公司是两种不同的法律实体。子公司具有独立的法人资格，而分公司则是母公司的分支机构，不具有独立的法人资格。当子公司变更为分公司时，员工的劳动关系、福利待遇等都会受到影响，因此必须依法进行妥善处理。

二、员工处理原则

1. 协商一致原则：

   • 在子公司变更为分公司的过程中，涉及员工劳动关系的变更（如从与子公司的劳动关系变为与母公司的劳动关系），应遵循协商一致的原则。即，必须与员工进行充分沟通，并征得其同意后，方可进行劳动关系的变更。

2. 内部消化为主：

   • 根据相关政策，撤并公司（此处可类比为子公司变更为分公司）的人员应主要通过“内部消化”的办法进行安置。即，由公司主管部门（在此情况下为母公司）在本系统内妥善安排员工的工作岗位。

3. 依法处理劳动关系：

   • 对于不同意变更劳动关系的员工，公司不能单方面强制变更或解除劳动合同。应依据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，与员工协商解除劳动合同，并依法支付经济补偿金。

三、具体处理措施

1. 岗位安排：

   • 母公司应根据分公司的业务需求和员工的专业技能、工作经验等，为员工安排合适的工作岗位。
   • 对于无法直接安排到分公司的员工，母公司可以考虑在本系统内其他子公司或关联企业进行安排。

2. 劳动关系变更：

   • 对于同意变更劳动关系的员工，母公司应与其签订新的劳动合同，明确双方的权利和义务。
   • 劳动合同的内容应包括工作岗位、工作地点、工资待遇、福利待遇等关键条款。

3. 经济补偿：

   • 对于不同意变更劳动关系或无法安排合适工作岗位的员工，母公司应依法与其协商解除劳动合同，并支付经济补偿金。
   • 经济补偿金的计算标准应依据《劳动合同法》的相关规定执行。

4. 福利待遇保障：

   • 员工变更劳动关系后，其福利待遇（如社会保险、住房公积金等）应依法进行转移和接续。
   • 母公司应确保员工的福利待遇不受子公司变更为分公司的影响。

四、注意事项

1. 遵守法律法规：

   • 在处理子公司变更为分公司过程中员工的问题时，必须严格遵守《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规的规定。

2. 做好思想工作：

   • 母公司应积极做好员工的思想工作，解释子公司变更为分公司的必要性和意义，以及员工安置方案的具体内容。
   • 通过沟通、协商等方式，争取员工的理解和支持。

3. 及时办理手续：

   • 对于需要变更或解除劳动合同的员工，母公司应及时办理相关手续，确保员工的合法权益得到保障。

综上所述，子公司变更为分公司时员工的处理应遵循协商一致、内部消化为主的原则，并依法进行劳动关系的变更或解除。同时，母公司应做好员工的思想工作，确保员工的合法权益得到保障。