行政相对人不服处罚提起行政诉讼后又撤诉的，行政机关申请强制执行三个月的起算点，一般应从行政诉讼撤诉裁定生效之日起计算。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国行政强制法》第五十三条的规定：“当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不履行行政决定的，没有行政强制执行权的行政机关可以自期限届满之日起三个月内，依照本章规定申请人民法院强制执行。”这一条款明确了行政机关申请强制执行的一般时间限制。然而，当行政相对人提起行政诉讼后又撤诉时，情况便有所变化。
二、撤诉后的时间起算点
撤诉裁定的生效：
- 行政相对人提起行政诉讼后，若选择撤诉，法院会作出撤诉裁定。该裁定一旦生效，即意味着行政诉讼程序的终结。
- 撤诉裁定的生效时间，通常是从裁定书送达当事人之日起计算，经过法定的上诉期（如无上诉，则上诉期满后生效）后确定。
三个月期限的起算：
- 在撤诉裁定生效后，行政机关若认为需要强制执行原行政决定，应自撤诉裁定生效之日起计算三个月的申请强制执行期限。
- 这是因为撤诉后，原行政决定的效力得以恢复，行政机关有权在法定期限内申请强制执行。
三、特殊情况与注意事项
复议与诉讼的衔接：
- 如果行政相对人在提起行政诉讼前已经申请了行政复议，且复议决定维持了原行政决定，那么撤诉后行政机关申请强制执行的期限可能受到复议决定的影响。但在此情况下，仍应以撤诉裁定生效之日为起算点。
执行内容的明确性：
- 行政机关在申请强制执行时，必须确保执行内容明确、具体，且符合法律法规的规定。否则，法院可能不予受理或驳回申请。
及时行使权利：
- 行政机关应密切关注行政诉讼的进展，一旦撤诉裁定生效，应及时在法定期限内申请强制执行，以免错过时机。
四、法律后果
- 如果行政机关未在法定期限内申请强制执行，可能会面临法院不予受理或驳回申请的法律后果。
- 此外，如果因行政机关未及时申请强制执行而导致行政决定无法得到有效执行，还可能引发行政相对人的进一步抗辩或投诉。
建议：行政机关在遇到此类情况时，应密切关注行政诉讼的进展，并在撤诉裁定生效后及时在法定期限内申请强制执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。