公司财务混同的情况下，是可以申请劳动仲裁的。以下从几个方面为你详细分析：

混同用工与劳动仲裁受理的关系

混同用工指的是两个或更多用人单位，由于多种因素，在人事管理和实际用工方面出现交叉或混淆。这种混淆使得劳动者很难分清自己工作到底归属于哪个单位，权益义务主体也变得模糊不清。在劳动仲裁中，混同用工的情况通常会被受理。因为劳动仲裁机构的目的之一就是明确劳动者的合法权益该如何保障，而混同用工正是导致劳动者权益不明确的一种情形。

劳动者在劳动仲裁中的举证责任

在劳动仲裁里，劳动者的关键任务是举证证明存在混同用工。对于财务混同这一方面，劳动者需要证明各单位资金往来界限不明。例如，可以提供工资发放记录、报销凭证、资金转账记录等，显示不同用人单位之间存在资金混用的情况。此外，劳动者还需要证明自己是因为这种混同状况而实际提供劳动。比如，可以提供工作记录、任务分配单、与不同单位管理人员的沟通记录等，以证明自己为不同“名头”的业务或单位实际提供了劳动服务。

仲裁机构的处理方式

只要劳动者完成基本举证责任，劳动仲裁机构一般会受理申请。之后，仲裁机构会依据相关法律法规，对劳动者与混同用工主体间的劳动关系和权益纠纷进行审查裁决。这包括确认劳动者与哪个或哪些用人单位存在劳动关系，以及劳动者应享有的工资、福利、社保等权益如何确定和保障。

实际案例参考

以小许的案例为例，小许入职一家公司工作，但工作期间发现存在混同用工情况。有两家关联公司在人事管理和实际用工上交叉混淆，小许难以分清自己的工作归属和权益义务主体。小许与公司就劳动关系及权益问题产生争议，于是向劳动仲裁机构申请仲裁。在这个案例中，如果小许能完成基本举证责任，证明不同用人单位间存在人员、业务、财务混同，且自己基于此混同实际提供劳动，仲裁机构一般会受理并审查裁决。

法律建议

如果你发现自己所在的公司存在财务混同或其他混同用工的情况，并且因此与公司在劳动关系或权益方面产生了争议，你可以积极收集相关证据，如工资单、报销凭证、工作记录等，以证明混同用工的存在以及自己因此实际提供的劳动。然后，你可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

在处理这类问题时，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。