针对您提出的“开发商只开首付款的发票是否合法”的问题，我可以明确地告诉您：在购房交易中，当您已支付完全部购房款项（包括首付款和贷款等）后，开发商有义务为您开具全额发票，这是法律赋予您的权利，也是开发商必须履行的法定义务。
法律依据与合同义务
相关法规明确：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在收取款项后，应向付款方开具发票。这一规定在商品房买卖中同样适用，即您支付完所有购房款后，开发商必须开具全额发票。
合同附随义务：
- 尽管购房合同中可能未具体约定开具全额发票的时间，但开具发票作为交易的一部分，是开发商的法定及合同附随义务。无论合同中有无明确条款，开发商均应在收到全部购房款后，及时为您开具全额发票。
实际情况与应对策略
贷款购房情况：
- 若您通过贷款方式购房，虽然个人仅支付了首付款，但银行已将剩余贷款支付给开发商。因此，从开发商的角度来看，其已收到全额购房款，应为您开具全额发票。
开发商常见借口及应对：
- 开发商可能会以楼盘手续未完、税务部门安排等为由拖延开票。但这些理由通常不成立。您可以明确指出开发商的法定义务，并要求其尽快开票。如遭拒绝，您可向当地税务部门投诉，税务部门有权检查并监督开发商的发票开具情况，并责令其改正。
全额发票的重要性：
- 全额发票不仅证明您已支付全部购房款，还是办理房产证等后续手续的重要凭证。因此，确保获得全额发票对于保障您的权益至关重要。
维权途径
若开发商拒绝或拖延开具全额发票，您可以采取以下措施维护自己的合法权益：
协商解决：
- 首先尝试与开发商进行友好协商，明确表达您的诉求和法律依据。
向税务部门投诉：
- 如协商无果，您可向当地税务部门投诉举报，请求其介入处理。税务部门有权对开发商的发票开具情况进行检查和监督，并责令其改正。
寻求法律帮助：
- 咨询专业律师，了解具体的法律途径和诉讼流程。必要时，您可以通过诉讼来维护自己的权益。
综上所述，您有权要求开发商在收到全部购房款后开具全额发票。这不仅是您的合法权益，也是开发商必须履行的法律义务。如遇拒绝或拖延，您应采取有效措施维护自己的权益。