面对大股东同时作为法人代表却擅自拿走公司公章的情况，作为公司的法定代表人（若您并非该大股东本人，而是代表公司利益的其他法人代表或高管），您需要采取一系列综合且有条理的措施来确保公司的正常运营及合法权益不受侵害。以下是一套详细的解决方案：
一、明确法律地位与公章重要性
首先，要明确公章是公司的重要财产，其使用和管理必须严格遵循公司章程及相关法律法规。作为公司的法定代表人，您有权也有责任维护公司公章的正常使用秩序，确保公司业务的合法性和连续性。
二、尝试沟通协商
- 了解原因：与大股东进行积极沟通，了解其拿走公章的具体原因和意图。这有助于您更准确地判断问题的性质，并找到和平解决的途径。
- 强调风险：向大股东详细说明公章对于公司日常运营的重要性，以及随意掌控公章可能带来的法律风险和业务障碍。通过理性沟通，尝试说服其归还公章。
三、启动内部管理程序
- 召集会议：依据公司章程，提议并召集股东会或董事会，就公章管理问题进行讨论。确保会议召集程序、表决方式等符合规定，以便所形成的决议具有法律效力。
- 制定管理制度：在会议上推动公司制定或完善公章管理制度，明确公章的保管、使用审批流程、使用范围等。要求全体股东和员工严格遵守，以确保公章使用的规范性和安全性。
四、采取法律途径
- 挂失补办公章：若沟通无果，且大股东的行为已经严重影响公司运营，您可以携带相关材料前往公安机关进行公章挂失，并申请补办新公章。这一步骤需谨慎操作，确保有充分理由，并遵循相关法律法规。
- 提起诉讼：
- 请求返还公章之诉：若大股东拒不归还公章，您可以代表公司向法院提起诉讼，要求其返还公章并赔偿因此造成的损失。
- 确认决议效力之诉：若已形成关于公章管理的有效决议，但大股东拒不执行，您可以向法院提起确认决议效力之诉，要求法院强制执行该决议。
五、采取辅助措施与加强风险防范
- 通知合作方：及时通知公司合作伙伴、客户、银行等相关方，告知他们公章管理的情况及风险。提醒他们在涉及公司重要事务时，要求提供法定代表人签字或其他有效授权文件，以确保交易的安全性。
- 加强财务监管：加强对公司财务的监管力度，确保财务部门严格按照财务制度进行审批和操作。对重大资金变动事项，除公章外还需法定代表人签字确认，以防止资金被滥用。
- 完善内部管理：为预防类似事件再次发生，应进一步完善公司内部管理制度。包括公章使用流程、管理人员设置、定期盘点检查等，以确保公司管理的规范性和有效性。
结论
面对大股东擅自拿走公章的情况，作为公司的法定代表人，您应首先尝试通过沟通协商解决问题。若无效，则应及时启动内部管理程序并形成有效决议。必要时，可采取法律途径维护公司权益。同时，还应采取一系列辅助措施和加强内部管理以防范风险。整个处理过程应遵循法律法规和公司章程的规定，确保合法合规、有理有据地维护公司的正常运营和合法权益。