针对您提出的“公司的考核罚款能否超过员工的工资”这一问题，我们可以从法律的角度进行详细分析。
首先，需要明确的是，公司直接以考核名义对员工进行罚款是违法的。罚款属于公权力范畴，其行使必须有明确的法律依据。企业作为民事主体，与员工之间建立的是平等的劳动关系，并不具备对员工进行罚款的法律权限。
接下来，我们根据《工资支付暂行规定》第十六条来具体分析。该规定指出，若劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，且赔偿额可从工资中扣除。但这里有几个关键限制：
扣除比例限制：每月扣除的部分不得超过当月工资的20%。这意味着，即使员工因个人原因给公司造成了经济损失，公司也不能无限制地扣除其工资作为罚款。
最低工资标准保障：扣除罚款后，员工的实际工资不得低于当地最低工资标准。这是为了保障员工的基本生活需求，防止公司因罚款而导致员工生活陷入困境。
此外，公司虽然无权直接罚款，但可以通过制定合法有效的规章制度及绩效考核制度来管理员工。这些制度应经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），内容不违反法律法规，并已向员工公示或告知。通过这样的制度，公司可以规范员工行为，并实施相应的经济管理措施，如设立“月考核奖”或“年考核奖”等综合考核奖项，将出勤、安全、质量、劳动纪律等方面纳入考核范围。
综上所述，公司的考核罚款不能超过员工的工资，且在实际操作中，公司应严格遵守相关法律法规和制度要求，确保罚款的合法性与合理性。如果公司违反规定进行罚款，员工有权拒绝，并可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径来维护自身的合法权益。