台风天停工，在综合工时制下算休息并不合法，这种休息通常应视为停工留薪，工资需照发。以下从不同角度为您详细分析：

一、综合工时制与工休的定义

• 综合工时制：是以标准工作时间为基础，以一定的期限为周期，综合计算工作时间的工时制度。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。
• 工休：一般指带薪年休假或企业规定的普通休息日。带薪年休假是劳动者连续工作一年以上的，享受带薪年休假；普通休息日则是企业根据生产经营情况安排的休息时间。

二、台风天停工的性质

• 台风属于不可抗力因素，当台风达到一定程度时，为了保障劳动者的生命安全，政府或企业会要求停工停产。
• 这种因台风导致的休息，并非劳动者主动申请的休假，而是由于外部原因造成的无法正常工作，因此不能视为工休。

三、工资支付规定

• 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。
• 超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的70%或80%（具体比例根据地区规定）支付劳动者基本生活费。
• 在台风天停工的情况下，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资，不能因停工而停发工资。

四、与工休的区别及法律后果

• 带薪年休假和普通休息日是劳动者依法享有的权利，期间工资照发。而因台风导致的休息，虽然工资也照发，但其性质并非工休，而是由于不可抗力因素造成的停工留薪。
• 如果用人单位将台风天停工视为工休并停发工资，可能构成违法，劳动者有权要求用人单位按劳动合同规定的标准支付工资。

五、处理建议

1. 了解公司政策：不同公司对于因自然灾害导致的停工可能有不同的处理政策，员工应提前了解公司的相关规定。
2. 保留相关证据：如因台风导致无法上班，员工应保留好相关证据，如气象部门发布的台风预警、公司通知等，以备不时之需。
3. 及时沟通：如果公司对台风天停工的处理方式存在疑问或争议，员工应及时与公司沟通，寻求解决方案。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。