结论： 结合新闻背景，省总工会“中国农民丰收节”慰问活动的组织程序是否合法合规，需从主体资格合法性、程序合规性、资金使用合规性及活动内容合法性四个维度综合分析。目前新闻未披露程序瑕疵，若活动严格遵循工会法、财务制度及内部管理规范，则程序合法；若存在越权审批、资金违规使用或内容越界，则可能涉嫌违法。以下为具体分析：

一、主体资格合法性：工会组织活动的法定权限

根据《中华人民共和国工会法》第六条、第三十二条，工会具有“维护职工合法权益”“组织职工开展群众性活动”的法定职责。省总工会作为省级工会组织，有权联合市总工会、农业农村部门等开展慰问活动，主体资格合法。
新闻背景印证：本次活动由省总工会与晋中市总工会共同开展，符合工会法规定的“上下级工会协同”模式，主体资格无争议。

二、程序合规性：审批与备案流程的合法性

工会开展慰问活动需遵循内部管理规范及财务制度：

1. 审批程序：根据《基层工会经费收支管理办法》，工会活动需经工会委员会或常委会审议通过，重大活动需报上级工会备案。若本次活动已履行内部审批程序，则程序合规。
   
2. 资金来源：慰问资金应来自工会经费，不得挪用其他专项资金。新闻未披露资金来源，但若资金使用符合《工会会计制度》规定的“慰问职工”科目，则合法。
   
3. 合作方资质：与农业农村厅、科协联合主办技能比武活动，需签订合作协议明确权责。若协议内容合法（如不涉及商业利益输送），则合作程序合规。
   

潜在风险点：若活动未履行审批程序、资金来源不明或合作协议存在利益冲突，可能涉嫌程序违法。

三、资金使用合规性：慰问活动的财务规范

根据《基层工会经费收支管理办法》，工会经费可用于“慰问困难职工”“开展群众性活动”，但需严格遵守以下规则：

1. 标准限制：慰问品或现金标准不得超过当地工会规定的上限（如每人不超过500元）。
   
2. 对象范围：慰问对象应为“三农”战线职工及农民工，不得扩大至非工会会员或无关人员。
   
3. 票据管理：活动支出需提供合法票据，严禁虚开发票或套取资金。
   

新闻背景印证：活动明确慰问对象为“长期拼搏奉献在‘三农’战线的职工和务工创业、辛苦打拼的农民工”，符合资金使用对象范围要求。若实际执行中未超标准、未虚开发票，则资金使用合规。

四、活动内容合法性：慰问与技能比武的边界

1. 慰问活动合法性：工会组织慰问属于法定职责，内容合法。但需避免以下情形：
   
   • 强制要求被慰问对象参与活动；
     
   • 慰问品附带商业广告或利益输送。
     
2. 技能比武活动合法性：联合农业农村厅、科协主办技能比武，需确保活动内容不涉及商业竞争或行政许可事项。若比武仅用于技术交流、减损宣传，则合法。
   

新闻背景印证：技能比武目的为“推动农业机械化高质量发展，做到减损就是增产增收”，属于公益性技术推广活动，内容合法。

五、热点事件延伸思考：工会活动的合规启示

1. 对工会组织的警示：需完善内部审批流程，留存审批文件、合作协议及财务票据，避免因程序瑕疵引发争议。
   
2. 对参与方的建议：农民工接受慰问时，可要求工会出示活动审批文件或资金使用说明，维护自身权益。
   
3. 对公众的启示：工会活动具有公益性，但需警惕“变相福利”或“利益输送”。若发现活动存在违规情形（如强制摊派、资金挪用），可向上级工会或劳动监察部门举报。

总结：新闻背景中的慰问活动，从主体资格、程序、资金及内容四个维度看，未披露明显违法情形。若实际执行中严格遵循工会法、财务制度及内部管理规范，则程序合法合规。建议工会组织未来开展类似活动时，完善审批留痕、资金公示及合作协议管理，进一步降低法律风险。如有具体程序疑问或争议，可直接向我咨询。