结论：公司使用您的账户做账，您是否需要退还相关款项，取决于款项的性质、公司做账的目的以及您与公司之间的约定。若款项属于公司应支付给您的合法工资或福利，且公司做账行为合法合规，您无需退还；若款项存在不当得利或公司做账行为违法，您可能需要退还或面临法律责任。
一、款项性质与做账目的
合法工资或福利：
- 若公司通过您的账户发放的款项属于您应得的合法工资或福利，且公司做账行为符合相关法律法规和财务制度，那么您无需退还这些款项。因为这是您与公司之间基于劳动合同或相关协议产生的合法债权债务关系。
不当得利：
- 若公司通过您的账户做账，但款项实际上并不属于您应得的部分，或者公司存在利用您的账户进行虚假做账、逃税等违法行为，那么您可能面临不当得利的风险。在这种情况下，如果公司要求您退还相关款项，或者税务、审计等部门发现并要求处理，您可能需要退还这些款项，并可能面临法律责任。
二、您与公司之间的约定
明确约定：
- 如果您与公司之间有明确的约定，规定公司可以使用您的账户进行做账，并且约定了相关款项的处理方式，那么您应当按照约定执行。如果约定中明确规定了您无需退还相关款项，那么您有权拒绝公司的退还要求。
无明确约定或约定不明：
- 如果您与公司之间没有明确的约定，或者约定不明确，那么您需要谨慎处理。在这种情况下，您可以与公司进行协商，明确款项的性质和做账的目的，以及双方的权利和义务。如果协商无果，您可以考虑咨询专业律师，通过法律途径解决争议。
三、法律建议与风险提示
保留证据：
- 无论您是否需要退还相关款项，都建议您保留好与款项相关的所有证据，包括工资单、银行转账记录、公司做账的凭证等。这些证据将有助于您在争议发生时维护自己的合法权益。
咨询专业律师：
- 如果您对公司使用您的账户做账的行为存在疑虑，或者公司要求您退还相关款项但您认为不合理，建议您及时咨询专业律师。律师将根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和解决方案。
注意法律风险：
- 需要注意的是，如果公司存在利用您的账户进行虚假做账、逃税等违法行为，您可能面临连带法律责任。因此，在处理此类问题时，您需要谨慎行事，避免卷入不必要的法律纠纷。