针对运输公司超限处罚，若一天内被处罚的车辆并非同一辆，是否可以再次处罚的问题，结论是：可以再次处罚，但需满足一定条件。
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国公路法》及《超限运输车辆行驶公路管理规定》等相关法律法规，超限运输车辆行驶公路，应当接受公路管理机构的监督检查，并按照要求采取有效措施防止货物脱落、扬撒等。对于超限运输的行为，公路管理机构有权依法进行处罚。这一原则适用于所有超限运输的车辆，无论是否为同一辆。
二、具体处罚情形分析
不同车辆超限：
- 若一天内，运输公司的不同车辆均存在超限运输行为，且每辆车的超限行为均独立构成违法事实，那么公路管理机构有权对每辆超限车辆分别进行处罚。这是因为每辆车的超限行为都是独立的违法行为，应当分别承担法律责任。
同一车辆多次超限：
- 若同一车辆在一天内多次超限运输，且每次超限均构成独立的违法事实（如每次超限的货物重量、尺寸等均不同），那么公路管理机构同样有权对每次超限行为分别进行处罚。但需注意，若同一车辆在短时间内连续多次超限，且超限情况相同或相似，公路管理机构在处罚时可能会考虑合并处罚或从重处罚的可能性。
处罚的合理性：
- 公路管理机构在处罚时，应当遵循合法、合理、公正的原则。对于不同车辆或同一车辆的不同超限行为，应当分别进行调查取证，确保处罚的依据充分、事实清楚。同时，处罚的幅度应当与违法行为的性质、情节以及社会危害程度相适应。
三、建议与注意事项
加强内部管理：
- 运输公司应当加强内部管理，确保所有运输车辆均符合规定的载重和尺寸要求，避免超限运输行为的发生。这不仅可以减少被处罚的风险，还可以提高运输效率、降低运输成本。
及时了解法规变化：
- 运输公司应当及时了解并遵守相关法律法规的变化，确保运输行为合法合规。对于超限运输的处罚标准、程序等，应当有清晰的认识和了解。
积极应对处罚：
- 若运输公司收到超限运输的处罚决定，应当积极应对，按照要求缴纳罚款、整改违法行为。同时，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身的合法权益。
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