针对您提出的“交通工程非法转包怎么调查处罚”的问题，我将从调查流程和处罚措施两个方面进行详细解答。
一、调查流程
线索收集与初步核实：
- 交通工程非法转包的线索可能来源于多个渠道，如群众举报、行业监管部门的日常巡查、媒体曝光等。
- 收到线索后，相关建设行政主管部门（如交通运输局）会进行初步核实，判断线索的真实性和可查性。
深入调查与证据收集：
- 若初步核实线索属实，主管部门会启动深入调查程序。
- 调查过程中，执法人员会收集相关证据，包括但不限于合同文件、计量支付报表、财务转账记录、项目管理往来文件、项目管理人员劳动合同等。
- 执法人员还可能对涉案单位进行现场勘查、询问相关人员等，以获取更全面的证据。
事实认定与法律适用：
- 在收集到足够证据后，主管部门会根据相关法律法规（如《建设工程质量管理条例》、《公路建设监督管理办法》等）对涉案行为进行事实认定。
- 认定非法转包行为后，主管部门会确定适用的法律条款和处罚标准。
二、处罚措施
责令改正与没收违法所得：
- 对于确认存在非法转包行为的单位，主管部门会责令其立即停止非法转包行为，并改正错误。
- 同时，主管部门会没收涉案单位通过非法转包获得的违法所得。
罚款：
- 根据《建设工程质量管理条例》和《公路建设监督管理办法》等相关规定，对非法转包的施工单位处以工程合同价款百分之零点五以上百分之一以下的罚款。
- 罚款金额会根据非法转包的情节严重程度、合同价款大小等因素进行具体确定。
停业整顿与降低资质等级：
- 若非法转包行为情节严重，主管部门会责令涉案单位停业整顿一段时间。
- 停业整顿期间，涉案单位需进行内部整改，提升管理水平，确保不再发生类似违法行为。
- 整顿期满后，主管部门会根据整改情况决定是否降低涉案单位的资质等级。
吊销资质证书：
- 对于情节特别严重、屡教不改的非法转包行为，主管部门会直接吊销涉案单位的资质证书。
- 吊销资质证书后，涉案单位将失去从事相关工程建设的资格。
连带赔偿责任：
- 若因非法转包导致工程质量不达标并造成损失，转包单位和接受转包的单位需承担连带赔偿责任。
- 这意味着双方需共同对损失进行赔偿，无法推卸责任。
三、实际案例参考
以某市交通运输局查处的非法转包案件为例，中标施工单位A公司将项目分解成两个标段，以签订分包合同的形式分别转交给同一集团公司系统内的另外两个子公司施工。经执法人员调查核实，A公司行为符合非法转包的定义，最终被处以罚款人民币7207433.5元的行政处罚。
综上所述，交通工程非法转包的调查处罚流程包括线索收集与初步核实、深入调查与证据收集、事实认定与法律适用等步骤；处罚措施则包括责令改正与没收违法所得、罚款、停业整顿与降低资质等级、吊销资质证书以及连带赔偿责任等。希望这些解答能对您有所帮助。