针对您提出的“公司迟到罚款是否可以申请仲裁”的问题，这确实需要根据具体情况来判断。以下是我为您详细梳理的分析和建议：

一、法律依据与核心原则

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，因劳动报酬、工伤医疗费等发生的争议属于劳动仲裁范围。罚款作为用人单位对劳动者的经济处罚，若涉及克扣工资或违反法定程序，可能构成劳动争议。但关键在于罚款的性质、依据及是否符合法律规定。

二、可申请仲裁的情形

1. 罚款缺乏制度依据：

   • 如果用人单位未通过民主程序制定罚款制度，或制度内容违反法律法规（如设定过高罚款金额），则罚款可能无效。
   • 示例：公司临时决定对迟到员工罚款500元/次，但未写入规章制度且未经职工代表大会讨论。

2. 罚款性质实为克扣工资：

   • 如果罚款直接从工资中扣除，导致实际收入低于当地最低工资标准，则涉嫌违法。
   • 数据参考：若某地月最低工资为2300元，罚款后实发工资不足此数额，则劳动者有权申请仲裁。

3. 罚款程序违法：

   • 如果用人单位未告知劳动者罚款事由、未提供申诉渠道，或未出具书面通知，则罚款程序可能违法。
   • 案例：公司以“工作失误”为由口头通知罚款，拒绝提供书面说明及证据。

4. 罚款目的不正当：

   • 如果用人单位以罚款替代管理责任，如将设备故障导致的损失全部由操作者承担，则罚款目的可能不正当。

三、不可仲裁或难以支持的情形

1. 合法合规的罚款：

   • 如果制度经民主程序制定并公示，罚款金额合理且与过错程度匹配，则罚款可能合法有效。
   • 示例：员工因重大过失造成公司10万元损失，按制度赔偿20%（即2万元），剩余部分由公司承担。

2. 非劳动关系纠纷：

   • 劳务关系中的罚款（如兼职人员）、民事合同约定的违约金不属于劳动仲裁范畴。

3. 证据不足的争议：

   • 如果劳动者无法证明罚款事实存在或制度违法，则仲裁申请可能难以得到支持。

四、操作建议

1. 收集证据：

   • 保存工资条、罚款通知书、公司制度文件等材料。
   • 若制度未公示或未签收，可通过录音、聊天记录等方式佐证。

2. 协商与投诉：

   • 先与公司人事部门沟通，要求解释罚款依据。
   • 向劳动监察大队投诉，请求调查制度合法性。

3. 申请仲裁：

   • 在知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。
   • 明确诉求（如返还罚款、补发工资差额），并提供充分证据。

4. 法律救济：

   • 对仲裁结果不服的，可在15日内向法院提起诉讼。

总结：公司迟到罚款是否可以申请仲裁，取决于罚款的性质、依据及是否符合法律规定。如果罚款缺乏制度依据、性质实为克扣工资、程序违法或目的不正当，则劳动者有权申请仲裁。在申请仲裁前，建议劳动者先收集证据、与公司协商或向劳动监察大队投诉。如果仲裁结果不满意，还可以通过法律途径进一步维权。