门市水表安装在水井内是否违法，需结合具体情况判断，但通常可能涉及违规，以下从不同角度分析：

1. 从供水设施安装规范角度
   根据《城市供水条例》及相关地方性法规，供水设施（包括水表）的安装需符合技术规范和安全要求。水表作为计量工具，其安装位置应便于读数、维护，且需防止被污染或损坏。若水井内环境潮湿、阴暗，或存在其他可能影响水表正常计量、导致数据不准确的因素（如水汽腐蚀、杂物遮挡），则可能违反安装规范。此外，若水井为公共设施或涉及他人权益，未经许可擅自安装还可能侵犯他人使用权。

2. 从物业管理或业主公约角度
   若门市位于商业综合体或住宅小区内，其供水设施的安装可能受物业管理规定或业主公约约束。若规定明确禁止在水井内安装水表，或要求统一安装至指定位置，则擅自安装可能构成违约，需承担相应责任（如恢复原状、赔偿损失等）。

3. 从安全与卫生角度
   水井内环境可能存在安全隐患（如井壁坍塌、溺水风险）或卫生问题（如细菌滋生、污染水源）。若水表安装导致上述风险增加，或影响水质安全，则可能违反《生活饮用水卫生监督管理办法》等法规，需承担行政责任或民事赔偿责任。

法律建议：

• 核查规范：首先查阅当地供水部门发布的安装规范或技术标准，确认水表安装位置是否合规。
  
• 协商解决：若涉及物业管理或业主公约，建议与物业或业主委员会沟通，协商调整安装位置。
  
• 整改或报批：若安装位置确实违规，应主动整改；若需特殊安装，应向相关部门报批并获得许可。
  

可能后果：

• 若违规安装被查处，可能面临罚款、责令整改等行政处罚。
  
• 若因安装导致他人损害（如水质污染、人身伤害），需承担民事赔偿责任。
  

总结：门市水表安装在水井内是否违法，需结合具体安装环境、规范要求及权益关系判断。建议优先核查规范、协商解决，避免法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询。