结论前置：两人合资开店但只有一个法人，在法律层面是可行的，但需通过明确的协议安排来保障双方权益，避免后续纠纷。以下是具体分析：

1. 法人资格与股东身份可分离

• 法人定义：法人指具有民事权利能力和民事行为能力的组织（如公司），其资格由工商登记确认，与股东人数无关。即使只有一人担任法定代表人（法人代表），公司仍可由多人合资。
• 股东身份：两人可通过签订《合资协议》或《股东协议》，明确各自出资比例、权益分配、决策机制等，即使仅一人登记为法定代表人，另一方仍可作为隐名股东或实际出资人享有权益。

2. 需注意的法律风险与防范

• 协议明确性：若未签订书面协议，仅凭口头约定可能导致权益争议。例如，利润分配、亏损承担、退出机制等需白纸黑字写清。
• 工商登记与实际不符：若另一方未在工商登记中体现为股东，可能被认定为“借名投资”，需通过《代持协议》明确其股东地位，并保留出资凭证。
• 法定代表人权限：法人代表有权代表公司签署合同、办理银行事务等，若其滥用职权损害另一方利益，需通过协议限制其权限（如重大事项需双方同意）。

3. 操作建议

• 签订《合资协议》：明确双方出资额、股权比例、分红规则、决策流程（如一票否决权）、违约责任等。
• 办理工商登记：若双方均希望显名，可登记为有限责任公司，两人均为股东；若仅一人显名，另一方需通过协议保障权益。
• 财务透明：建立独立账户，定期对账，避免资金混同。

4. 示例协议条款

• 出资条款：“甲方出资60%，乙方出资40%，均以货币形式于202X年X月X日前汇入公司账户。”
• 决策条款：“单笔超过1万元的支出需双方签字确认；修改公司章程需全体股东同意。”
• 退出条款：“任一方退出需提前30日通知，按出资比例回购股权，溢价/折价按上年度净利润的X倍计算。”

总结：两人合资开店可仅设一名法人，但务必通过书面协议明确双方权利义务，并建议咨询律师起草或审核协议，以降低法律风险。若有进一步疑问，可直接向我提问。