员工离开岗位一小时是否算旷工以及是否合法，需分情况讨论：
若公司规章制度明确规定：
- 如果公司的规章制度中明确规定了员工离岗的时间限制，并且明确指出离岗超过一定时间（如一小时）即视为旷工，同时该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等）并公示给员工，那么员工离开岗位一小时，按照公司规定，是可以被认定为旷工的。这种情况下，公司的处理是合法的，但前提是规章制度本身合法且已公示。
若公司规章制度无明确规定或规定不合法：
- 如果公司没有明确的规章制度规定离岗时间，或者规章制度未经民主程序制定、未公示，那么公司不能仅凭员工离岗一小时就认定为旷工。此时，公司的处理可能缺乏合法依据，员工有权对此提出异议。
- 另外，即使规章制度有规定，但如果规定的内容过于苛刻或不合理（如离岗五分钟即视为旷工），也可能因违反公平、合理原则而被认定为无效。在这种情况下，公司依据无效规章制度作出的旷工认定也是不合法的。
从劳动法角度分析：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者有权享受休息休假，用人单位应当合理安排劳动者的工作和休息时间。如果员工因合理原因（如上厕所、接电话等）短暂离岗，且未对工作造成实质性影响，那么将其认定为旷工可能过于严厉，也不符合劳动法的精神。
法律建议：
- 对于员工而言，如果因短暂离岗被公司认定为旷工并受到处罚，可以首先查看公司的规章制度是否合法且已公示。如果认为公司的处理不合法或不合理，可以通过内部申诉、劳动争议调解或仲裁等途径维护自己的权益。
- 对于公司而言，应当制定合法、合理且明确的规章制度，并确保这些制度已经过民主程序制定并公示给员工。同时，在处理员工离岗问题时，应当综合考虑离岗的原因、时间以及对工作的影响等因素，避免过于严厉或不合法的处理。
可能的法律后果：
- 如果公司违法认定旷工并处罚员工，可能面临劳动争议仲裁或诉讼的风险。在仲裁或诉讼中，如果公司无法提供合法有效的证据证明其处理的合法性，可能会承担不利后果，如支付赔偿金、恢复劳动关系等。
总之，员工离开岗位一小时是否算旷工以及是否合法，需根据公司的规章制度、劳动法的相关规定以及具体情况来综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。