烟草专卖零售许可证有效期内违法两次，其延续会受到影响。具体分析如下：

1. 法规依据：

   • 根据《烟草专卖许可证管理办法》的相关规定，因违法生产经营烟草专卖品一年内被烟草专卖局或者其他执法机关处罚两次以上的，发证机关可以责令持证人暂停烟草专卖业务、进行整顿，直至依法取消其从事烟草专卖业务的资格。此处的“一年”是指从第一次违法行为发生之日起到第二次违法行为发生之日止的时间段，而非自然年。

2. 对延续的影响：

   • 若持证人在烟草专卖零售许可证有效期内违法两次，这将被视为严重违法经营行为。
   • 在申请延续烟草专卖零售许可证时，发证机关会审查持证人的经营行为和遵纪守法情况。
   • 由于存在两次违法记录，发证机关可能会认为持证人不再具备从事烟草专卖品零售业务的良好信誉和合规经营能力。
   • 因此，发证机关可能会作出不予延续烟草专卖零售许可证的决定。

3. 实际案例：

   • 例如，某烟草专卖零售户在许可证有效期内因销售非法渠道进购的烟草制品被处罚两次。在许可证有效期届满前，该零售户申请延续许可证，但发证机关根据其违法记录，决定不予延续。

我建议：若您作为烟草专卖零售许可证的持证人，在有效期内已违法两次，应高度重视此事对许可证延续的影响。您应积极整改，加强合规经营意识，并咨询当地烟草专卖局了解具体的延续政策和要求。同时，也要做好可能无法延续许可证的准备，并考虑相应的应对措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。