配合公安机关调查，提供公司财务资料，本身并不违法。但这一行为是否合法，需结合具体情况从多个角度进行详细分析：

1. 合法配合调查的情形

• 依法配合：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律规定，公安机关在侦查刑事案件时，有权要求相关单位和个人提供与案件有关的资料。若公司收到的配合调查通知是合法有效的，且公司按照要求提供了真实、完整的财务资料，那么这一行为是合法的。
• 资料真实性：公司提供的财务资料必须真实、准确，不得伪造、篡改或隐瞒。若公司故意提供虚假资料，可能构成妨碍公务或伪造证据等违法行为，将面临法律责任。

2. 可能涉及违法的情形

• 未经合法程序要求提供资料：如果公安机关未按照法定程序要求公司提供财务资料，或者公司未收到合法有效的配合调查通知，而擅自提供资料，可能涉及侵犯公司商业秘密或违反其他法律法规的风险。但这种情况更多是指公安机关的程序违法，而非公司本身的行为违法。不过，公司在此情况下应谨慎对待，要求公安机关出示合法手续。
• 资料泄露：公司在提供财务资料的过程中，若因保管不善或故意泄露导致资料被不当使用，可能构成泄露商业秘密或侵犯他人隐私等违法行为。因此，公司在提供资料时，应确保资料的安全性和保密性。

3. 法律建议

• 核实通知合法性：公司在收到公安机关的配合调查通知时，应首先核实通知的合法性和有效性。可以要求公安机关出示相关法律文书或手续，以确保配合调查的行为符合法律规定。
• 咨询专业律师：若公司对配合调查的要求存在疑虑或不确定如何操作，应及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和指导，帮助公司合法、合规地配合调查。
• 保留证据：公司在提供财务资料的过程中，应保留好相关证据，如配合调查的通知、提供的资料清单等。这些证据可以在后续可能出现的法律纠纷中作为证明公司合法行为的依据。

4. 可能的法律后果

• 若合法配合：公司不会因提供财务资料而承担法律责任。相反，积极配合调查有助于维护公司的社会形象和声誉。
• 若违法提供：如公司故意提供虚假资料或泄露资料导致严重后果，可能面临罚款、赔偿损失甚至刑事责任等法律后果。

总结来看，配合公安机关调查并提供公司财务资料本身并不违法，但公司必须确保配合调查的行为符合法律规定，提供的资料真实、准确，并采取必要的保密措施。若公司对此存在疑虑或不确定如何操作，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供法律意见和指导。