针对您提出的“在法院审理环节，刑事案件超过诉讼时效的如何判决”这一问题，我将结合相关法律规定和实际操作，为您详细解答。

一、基本原则

首先，需要明确的是，对于已过追诉时效的刑事案件，法院在审判阶段通常应裁定终止审理。这一原则是基于《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，即“犯罪已过追诉时效期限的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件、不起诉、终止审理或宣告无罪”。

二、不同诉讼阶段的处理

1. 侦查阶段：

   • 若侦查机关在侦查过程中发现案件已过追诉时效，应撤销案件，不再继续侦查。这意味着，一旦案件被认定为超过追诉时效，侦查工作将立即停止。

2. 审查起诉阶段：

   • 案件移送至检察院后，若检察院审查发现已过追诉时效，应作出不起诉决定。此时，案件不会进入审判程序，而是直接以不起诉的方式结案。

3. 审判阶段：

   • 若案件已进入审判程序，法院在审理过程中发现已过追诉时效，应裁定终止审理。这意味着，即使被告人被指控犯有罪行，也因其行为已超过法律规定的追诉时效而免受法律制裁。
   • 特殊情况：若在审理过程中已查明被告人确实无罪，法院应判决宣告被告人无罪。这一规定体现了法律的公正性和对被告人权益的保护，即不能仅因追诉时效过期而让无辜的人承受法律后果。

三、特殊情况下的追诉

虽然一般情况下，超过追诉时效的案件将不再追究刑事责任，但在某些特殊情况下，如涉及重大公共利益或必须追诉的情形，可能需要经过最高人民检察院的核准来继续追诉。然而，这属于例外情况，并不改变一般原则。

四、举例说明

以一个具体案例为例：假设张三被指控在10年前实施了一起盗窃案，该盗窃行为的法定最高刑为三年以下有期徒刑。根据《刑法》规定，其追诉时效为五年。当案件进入审判阶段时，若法院查明本案已过追诉时效期限（即从犯罪之日起已超过五年），且没有证据表明张三逃避侦查或审判，也没有被害人在追诉期限内提出控告而司法机关未立案的情况，那么法院将作出终止审理的裁定。

但如果在审理过程中，有确凿证据证明张三并未实施该盗窃行为（即张三确实无罪），那么法院应判决宣告张三无罪，而不是仅因追诉时效过期而终止审理。

五、总结与建议

综上所述，对于已过追诉时效的刑事案件，在法院审理环节通常应裁定终止审理。但在特殊情况下，如已查明被告人确实无罪，则应判决宣告被告人无罪。若您面临此类问题或需要更具体的法律建议，请务必咨询专业的律师以获取准确的法律意见和帮助。