单位让工人追回三年绩效工资，确实存在诉讼时效的问题，且主要涉及一般诉讼时效和劳动仲裁时效两个方面。

1. 一般诉讼时效：

   • 根据相关法律规定，公司追回员工多发放的工资（在此可类比为追回绩效工资的情况）适用三年的一般诉讼时效。这一时效从公司知道或应当知道其权利受到损害以及义务人是谁时开始计算。
   • 计算公式：若公司发现多发放绩效工资（或应追回的绩效工资）的日期为A，则诉讼时效期满日为A+3年。例如，若公司在2023年1月1日发现应追回的绩效工资问题，则诉讼时效至2026年1月1日届满。
   • 如果公司超过这个三年时效期才追讨，可能会因为时效已经经过而难以保障其权益。

2. 劳动仲裁时效：

   • 若该争议属于劳动争议范畴，公司还应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁。
   • 对于劳动者而言，如果劳动关系存续期间因工资（包括绩效工资）问题发生争议，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效的限制；但如果劳动关系已经终止，则劳动者需在劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。
   • 特殊情况：如果公司对劳动仲裁结果不服，还可以在规定的时间内向法院提起诉讼。

法律建议：

• 对于公司而言，如果发现需要追回绩效工资的情况，应及时采取行动，避免超过诉讼时效或劳动仲裁时效。
• 对于劳动者而言，如果公司提出追回绩效工资的要求，且认为该要求已经超过了合理的时效期限，可以依法进行抗辩。

可能后果：

• 如果公司未能在时效期内追回绩效工资，可能会面临无法通过法律途径追回的风险。
• 如果劳动者未能在规定的时效期内提出仲裁申请或诉讼，也可能会丧失通过法律途径维护自己权益的机会。

在实际操作中，每个案件的具体情况都会有所不同，因此建议当事人在遇到类似问题时，及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。